177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_tRNASerVIMSS1309348 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_tRNASerVIMSS1309348  tRNA-Ser  100 
 
 
85 bp  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00366383 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNASerVIMSS1309262  tRNA-Ser  97.78 
 
 
87 bp  81.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0016  tRNA-Ser  95.65 
 
 
87 bp  75.8  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.116346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0035  tRNA-Ser  95.65 
 
 
87 bp  75.8  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4306  tRNA-Ser  89.19 
 
 
90 bp  67.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0019  tRNA-Ser  86.36 
 
 
87 bp  67.9  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNASerVIMSS1309077  tRNA-Ser  86.36 
 
 
87 bp  67.9  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.537864  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNASerVIMSS1309109  tRNA-Ser  86.36 
 
 
87 bp  67.9  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.701033  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0070  tRNA-Ser  89.19 
 
 
90 bp  67.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNASerVIMSS1309153  tRNA-Ser  86.36 
 
 
87 bp  67.9  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0002  tRNA-Ser  85.56 
 
 
92 bp  58  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000138039  hitchhiker  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0414  tRNA-Ser  83.53 
 
 
85 bp  58  0.0000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.897542  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0001  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  56  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0058  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  56  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481148  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0020  tRNA-Ser  92.5 
 
 
90 bp  56  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.178349  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0023  tRNA-Ser  92.5 
 
 
90 bp  56  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0350169 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0101  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.174048  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  54  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.44549  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt03  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  54  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.038347  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 
88 bp  54  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.59905e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  54  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.507885  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0026  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  54  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.369996  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0033  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  54  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_513  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  54  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0001  tRNA-Ser  100 
 
 
89 bp  54  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000514478  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0815  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  54  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0378889  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0009  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  54  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0027  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  54  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0526  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  54  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0043  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  54  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179868  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0061  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  54  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.388434  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0002  tRNA-Ser  94.12 
 
 
87 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0017  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0043  tRNA-Ser  100 
 
 
86 bp  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0015  tRNA-Ser  86.21 
 
 
90 bp  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.399883  normal  0.370558 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNASerVIMSS1309197  tRNA-Ser  94.12 
 
 
87 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.159743  normal  0.113678 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  90.24 
 
 
88 bp  50.1  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0011  tRNA-Ser  96.55 
 
 
87 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3054  tRNA-Ser  90.24 
 
 
88 bp  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1581  tRNA-Ser  90.24 
 
 
88 bp  50.1  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151315  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0059  tRNA-Ser  90.24 
 
 
88 bp  50.1  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0810  tRNA-Ser  90.24 
 
 
88 bp  50.1  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0309716  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNASerVIMSS1309192  tRNA-Ser  96.55 
 
 
87 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2643  tRNA-Ser  90.24 
 
 
88 bp  50.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2954  tRNA-Ser  90.24 
 
 
88 bp  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.876099  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3020  tRNA-Ser  90.24 
 
 
88 bp  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.419002  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1969  tRNA-Ser  90.24 
 
 
88 bp  50.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.156913  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0030  tRNA-Ser  90.24 
 
 
90 bp  50.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.993805 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0003  tRNA-Ser  96.43 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352958  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0024  tRNA-Ser  88.64 
 
 
90 bp  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000192923  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0002  tRNA-Ser  96.43 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0040  tRNA-Ser  83.33 
 
 
88 bp  48.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000505544  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tSer03  tRNA-Ser  90 
 
 
93 bp  48.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000286931  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0041  tRNA-Ser  96.43 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.926323  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0044  tRNA-Ser  96.43 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0001  tRNA-Ser  96.43 
 
 
90 bp  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00401168  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNASerVIMSS1309256  tRNA-Ser  96.43 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123875 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0006  tRNA-Ser  96.43 
 
 
90 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.121639  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNASerVIMSS1309347  tRNA-Ser  96.43 
 
 
88 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233561 
 
 
-
 
NC_003295  RS01162  tRNA-Ser  96.3 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0044  tRNA-Ser  96.3 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.417846 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0046  tRNA-Ser  96.3 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40906  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0029  tRNA-Ser  96.3 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0026    96.3 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0760613  normal  0.460066 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0009  tRNA-Ser  96.3 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56396 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0060  tRNA-Ser  96.3 
 
 
91 bp  46.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0238234  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0037  tRNA-Ser  96.3 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.552726  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0071  tRNA-Ser  96.3 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.612949  normal  0.325522 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0011  tRNA-Ser  96.3 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0710717  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0041  tRNA-Ser  96.3 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0730439  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0040  tRNA-Ser  96.3 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386167  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0037  tRNA-Ser  96.3 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0421417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0030  tRNA-Ser  96.3 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.849468  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0006  tRNA-Ser  96.3 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0009  tRNA-Ser  96.3 
 
 
91 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0314444  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0027  tRNA-Ser  96.3 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0026  tRNA-Ser  96.3 
 
 
91 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.199991  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0025  tRNA-Ser  96.3 
 
 
91 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.488761  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0026  tRNA-Ser  96.3 
 
 
91 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306845  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0039  tRNA-Ser  96.3 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.801401  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0060  tRNA-Ser  96.3 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276036  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0049  tRNA-Ser  96.3 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0051  tRNA-Ser  96.3 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0044  tRNA-Ser  96.3 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0020  tRNA-Ser  96.3 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000279597  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0017  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0058  tRNA-Ser  96.3 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0026  tRNA-Ser  96.3 
 
 
91 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0072  tRNA-Ser  96.3 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.789725  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0001  tRNA-Ser  96.3 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000971993  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0004  tRNA-Ser  96.3 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0020  tRNA-Ser  96.3 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.437466  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA21  tRNA-Ser  96.3 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213698  normal  0.11304 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0020  tRNA-Ser  96.3 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474391  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0008  tRNA-Ser  96.3 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.109766  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0047  tRNA-Ser  96.3 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.740816  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0016  tRNA-Ser  96.3 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.25212  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0018  tRNA-Ser  96.3 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0046  tRNA-Ser  96.3 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.557666 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0055  tRNA-Ser  96.3 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.983952 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>