7 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_R0005 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.933104  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0074  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0040  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.66072  hitchhiker  0.00010969 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0062  tRNA-Ser  83.58 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0061  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.017138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0063  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000545483 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0029  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124844  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>