40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_R0004 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_R0004  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0773482 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0006  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.226998  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  50.1  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0087  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  50.1  0.00008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0034  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  50.1  0.00008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0020  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  50.1  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.111386  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  50.1  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.609498  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ser-5  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  50.1  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0011  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0710717  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0063  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.874124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0024  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896566  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0001  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00401168  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0003  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352958  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0027  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0072  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.789725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0030  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.849468  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0085  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0013  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0037  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0421417 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0065  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0020  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0294133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0062  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2408  normal  0.378741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0014  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0041  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.368592 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0013  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0029  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0078  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.412983 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0023  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0350169 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0020  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000279597  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0024  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.771773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0060  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0020  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.178349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0063  tRNA-Ser  88.1 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000545483 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0055  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.983952 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0046  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557666 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0016  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.25212  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.109766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0020  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474391  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0061  tRNA-Ser  88.1 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.017138 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0011  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.785527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>