More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1539 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  370  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  72.43 
 
 		 185 aa  281  4.0000000000000003e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1866  ribosome recycling factor  70.81 
 
 		 185 aa  280  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1532  ribosome recycling factor  69.73 
 
 		 185 aa  279  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0437112 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3579  ribosome recycling factor  65.41 
 
 		 185 aa  262  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0679  ribosome recycling factor  65.41 
 
 		 185 aa  260  8e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445733  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1183  ribosome recycling factor  65.41 
 
 		 185 aa  259  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1164  ribosome recycling factor  63.78 
 
 		 185 aa  259  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.221517 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5908  ribosome recycling factor  64.86 
 
 		 185 aa  258  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.107758  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3988  ribosome recycling factor  66.49 
 
 		 185 aa  255  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3407  ribosome recycling factor  69.19 
 
 		 185 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0276302  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1325  ribosome recycling factor  64.32 
 
 		 185 aa  253  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  64.32 
 
 		 185 aa  253  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1233  ribosome recycling factor  64.32 
 
 		 185 aa  251  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.408531  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12896  ribosome recycling factor  63.24 
 
 		 185 aa  251  3e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.460587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1418  ribosome recycling factor  65.41 
 
 		 185 aa  251  5.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.441102 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3240  ribosome recycling factor  65.41 
 
 		 185 aa  251  6e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  64.32 
 
 		 185 aa  249  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0241  ribosome recycling factor  63.24 
 
 		 185 aa  248  5e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1387  ribosome recycling factor  63.24 
 
 		 185 aa  247  9e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000002033 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3110  ribosome recycling factor  62.7 
 
 		 185 aa  246  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000193761  hitchhiker  0.00426294 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2004  ribosome recycling factor  61.62 
 
 		 185 aa  246  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  62.7 
 
 		 185 aa  246  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1985  ribosome recycling factor  61.62 
 
 		 185 aa  246  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2050  ribosome recycling factor  61.62 
 
 		 185 aa  246  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4123  ribosome recycling factor  60.54 
 
 		 185 aa  245  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23580  ribosome recycling factor  62.7 
 
 		 185 aa  243  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.275445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2221  ribosome recycling factor  61.62 
 
 		 185 aa  242  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0750591  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2504  ribosome recycling factor  62.7 
 
 		 185 aa  241  5e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1487  ribosome recycling factor  64.86 
 
 		 185 aa  241  5e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.632003 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1674  ribosome recycling factor  58.38 
 
 		 185 aa  238  4e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1370  ribosome recycling factor  61.08 
 
 		 185 aa  238  4e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102814  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2201  ribosome recycling factor  58.92 
 
 		 185 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11220  ribosome recycling factor  58.7 
 
 		 186 aa  227  7e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0977787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06770  ribosome recycling factor  56.22 
 
 		 185 aa  226  2e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000531316  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10150  ribosome recycling factor  57.46 
 
 		 188 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.775897  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  52.17 
 
 		 186 aa  207  7e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  204  5e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  204  6e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 186 aa  204  7e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 184 aa  202  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0806  ribosome recycling factor  52.25 
 
 		 184 aa  202  3e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  201  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 192 aa  199  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  53.11 
 
 		 184 aa  197  6e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 184 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 184 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  53.89 
 
 		 186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 186 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  51.63 
 
 		 185 aa  194  4.0000000000000005e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  194  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  194  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  194  7e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1142  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 183 aa  191  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  47.73 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  51.67 
 
 		 181 aa  191  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0407  ribosome recycling factor  48.88 
 
 		 183 aa  190  8e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00332415  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0629  ribosome recycling factor  53.26 
 
 		 190 aa  191  8e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.701086  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  189  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0660  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  189  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 184 aa  190  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  51.11 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03234  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1848  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  188  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000201497  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0566  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.395524  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  50 
 
 		 182 aa  187  9e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3928  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  51.11 
 
 		 187 aa  186  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2016  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0510  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0317856  normal  0.376064 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3431  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000510427  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0241  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.331553 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0183  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.07548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0176  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000066149  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0257  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.585226 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3488  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00730416  normal  0.367592 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002749  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000016264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>