More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0855 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0855  flagellar motor switch protein FliN  100 
 
 		 123 aa  237  5e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.172432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2333  flagellar motor switch protein FliN  73.42 
 
 		 250 aa  114  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0940353  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0745  flagellar motor switch protein FliN  58.93 
 
 		 246 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.898519  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0964  flagellar motor switch protein FliN  72.84 
 
 		 249 aa  110  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1664  flagellar motor switch protein FliN  53.7 
 
 		 249 aa  110  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  58.75 
 
 		 346 aa  102  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  49.48 
 
 		 422 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  58.75 
 
 		 346 aa  101  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31080  flagellar motor switch protein FliN  54.17 
 
 		 247 aa  101  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.713514  normal  0.558701 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  60.26 
 
 		 375 aa  100  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  44.44 
 
 		 357 aa  100  9e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  56.32 
 
 		 97 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  55.17 
 
 		 97 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  55.17 
 
 		 97 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2013  flagellar motor switch protein FliN  56.76 
 
 		 259 aa  97.4  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2978  flagellar motor switch protein FliN  52.81 
 
 		 238 aa  97.4  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563329 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  54.55 
 
 		 375 aa  95.9  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  46.94 
 
 		 175 aa  95.5  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0151  flagellar motor switch protein FliN  58.23 
 
 		 95 aa  95.5  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1938  flagellar motor switch protein FliN  51.11 
 
 		 359 aa  95.1  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  54.67 
 
 		 190 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  54.67 
 
 		 180 aa  94  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  46.88 
 
 		 155 aa  94  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2702  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  47.87 
 
 		 401 aa  94  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0537803  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  54.67 
 
 		 175 aa  94  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  53.85 
 
 		 372 aa  93.6  8e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  56.58 
 
 		 393 aa  93.6  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  52 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0055  flagellar motor switch protein FliN  52.63 
 
 		 130 aa  92  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  47 
 
 		 370 aa  92  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  53.33 
 
 		 170 aa  92  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2160  flagellar motor switch protein  54.67 
 
 		 378 aa  91.3  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000995507  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  54.43 
 
 		 381 aa  90.5  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  44.12 
 
 		 398 aa  90.5  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  53.95 
 
 		 417 aa  90.5  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  54.67 
 
 		 401 aa  90.1  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1755  flagellar motor switch protein FliN  54.05 
 
 		 111 aa  89.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  50.62 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  38.79 
 
 		 163 aa  89.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  45.92 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 162 aa  88.6  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2763  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1755  flagellar motor switch protein FliN  54.05 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  38.79 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 162 aa  88.6  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  53.33 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  38.79 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  38.79 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0042  flagellar motor switch protein FliN  46.32 
 
 		 159 aa  88.6  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 162 aa  88.6  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  38.79 
 
 		 161 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  39.17 
 
 		 163 aa  88.2  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  40.52 
 
 		 152 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1696  flagellar motor switch protein FliN  50.59 
 
 		 98 aa  87.8  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000449848 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0061  flagellar motor switch FliN protein  50.59 
 
 		 98 aa  87.8  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.517527  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3292  flagellar motor switch protein FliN  45.45 
 
 		 99 aa  87.4  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1649  flagellar motor switch protein FliN  52.5 
 
 		 98 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211247  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0478  flagellar motor switch protein  46.43 
 
 		 406 aa  87  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000894996  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2038  flagellar motor switch protein  41.28 
 
 		 402 aa  87  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0278595  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2908  flagellar motor switch protein FliN  40.95 
 
 		 155 aa  87  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  47.13 
 
 		 135 aa  87  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  50 
 
 		 375 aa  86.7  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  51.9 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  51.9 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  51.9 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4176  flagellar motor switch protein FliN  53.16 
 
 		 155 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1353  surface presentation of antigens (SPOA) protein  36.3 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  51.9 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  51.9 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  51.9 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  46 
 
 		 203 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  51.9 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  51.9 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  50.63 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  51.9 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1431  Type III secretion system outer membrane O protein  42.73 
 
 		 153 aa  85.5  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  51.25 
 
 		 360 aa  85.5  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  51.9 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  51.9 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  51.9 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0283  flagellar switch protein FliY  46.99 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  40.71 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  47.25 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  48 
 
 		 188 aa  85.5  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  47.25 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  45.1 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  51.9 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3438  flagellar motor switch protein FliN  47.44 
 
 		 99 aa  85.5  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  47.06 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4201  flagellar motor switch protein FliN  42.35 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1608  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein FliN  45.05 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429927  normal  0.0945773 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  41.67 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  50.63 
 
 		 137 aa  84.7  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2164  surface presentation of antigens (SPOA) protein  41.07 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>