73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0417 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0417  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  100 
 
 		 905 aa  1797    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.46141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0424  glycoside hydrolase family protein  50.82 
 
 		 793 aa  374  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.723978 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0423  SpoIID/LytB domain-containing protein  45.48 
 
 		 874 aa  326  1e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4329  LGFP repeat protein  41 
 
 		 928 aa  263  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.57 
 
 		 959 aa  234  8.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3174  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  44.34 
 
 		 694 aa  226  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15405  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2379  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  38.54 
 
 		 879 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0196  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  39.1 
 
 		 502 aa  213  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3877  LGFP repeat protein  41.53 
 
 		 654 aa  210  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.200487  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5110  LGFP repeat-containing protein  34.71 
 
 		 537 aa  200  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.667896 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5022  LGFP  34.71 
 
 		 537 aa  200  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5403  LGFP repeat-containing protein  34.71 
 
 		 537 aa  200  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.116536 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3789  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.25 
 
 		 591 aa  196  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0099  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  37.08 
 
 		 552 aa  194  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1157  LGFP repeat-containing protein  36.77 
 
 		 541 aa  194  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0583206  normal  0.0991304 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1023  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  35.64 
 
 		 636 aa  190  9e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4477  LGFP repeat-containing protein  43.5 
 
 		 370 aa  184  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5652  LGFP repeat-containing protein  34.02 
 
 		 539 aa  182  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.786051  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2561  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  37.61 
 
 		 784 aa  176  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13845  hypothetical protein  43 
 
 		 539 aa  175  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.280356 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2558  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  35.26 
 
 		 728 aa  173  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.39914  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34600  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.9 
 
 		 387 aa  167  6.9999999999999995e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.123006  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20080  LysM domain-containing protein  31.02 
 
 		 695 aa  160  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1188  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  37.46 
 
 		 794 aa  152  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.469744  normal  0.0598623 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2624  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  31.61 
 
 		 950 aa  145  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0009  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  31.72 
 
 		 684 aa  135  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2674  glycoside hydrolase family protein  31.85 
 
 		 829 aa  134  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2409  Lysozyme  30.91 
 
 		 935 aa  127  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.20099 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1539  twin-arginine translocation pathway signal  38.1 
 
 		 486 aa  117  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.407284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3432  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.52 
 
 		 964 aa  116  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0164906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4245  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.31 
 
 		 1072 aa  113  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1610  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.68 
 
 		 964 aa  109  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3238  hypothetical protein  38.03 
 
 		 296 aa  108  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4840  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  30.05 
 
 		 277 aa  102  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5070  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  32.74 
 
 		 353 aa  101  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212369  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2393  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.11 
 
 		 268 aa  96.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1925  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase  30.58 
 
 		 289 aa  94.4  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0536095  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2719  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  31.08 
 
 		 274 aa  92.8  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1929  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  31.34 
 
 		 223 aa  88.6  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0455  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  31.62 
 
 		 357 aa  82.4  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2816  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  27.62 
 
 		 542 aa  82.8  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3434  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.86 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.0021339  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0270  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  30.67 
 
 		 364 aa  80.5  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.25 
 
 		 356 aa  80.5  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35340  negative regulator of beta-lactamase expression  28.84 
 
 		 311 aa  79.7  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.3 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1928  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  26.57 
 
 		 391 aa  77.4  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  28.1 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4945  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  25.12 
 
 		 273 aa  73.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3182  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  25.47 
 
 		 375 aa  72.8  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209082 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16840  hypothetical protein  27.67 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.754207  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0529  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase, putative  27.7 
 
 		 222 aa  59.3  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.549299  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0545  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.7 
 
 		 157 aa  59.3  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3670  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.64 
 
 		 152 aa  58.9  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0492519  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5274  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  28.18 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3428  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.83 
 
 		 150 aa  57  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1572  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.64 
 
 		 150 aa  57  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.577314  normal  0.236623 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3698  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.83 
 
 		 150 aa  57  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.694196  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3648  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.63 
 
 		 150 aa  55.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3323  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  31.78 
 
 		 150 aa  55.8  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0947828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3340  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.78 
 
 		 152 aa  55.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3389  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.63 
 
 		 152 aa  55.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0561834  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3666  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, putative  31.53 
 
 		 150 aa  55.1  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2303  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.63 
 
 		 157 aa  55.1  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2671  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  24.34 
 
 		 792 aa  54.7  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342561  normal  0.283165 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3745  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.71 
 
 		 150 aa  54.3  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3053  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.89 
 
 		 792 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0646042 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5184  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  28.93 
 
 		 279 aa  48.9  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3764  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  29.88 
 
 		 288 aa  47.8  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0204504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3186  hypothetical protein  27.81 
 
 		 256 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1203  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.95 
 
 		 979 aa  47  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0815381  normal  0.647955 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4129  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  28.57 
 
 		 406 aa  45.8  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1669  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.08 
 
 		 173 aa  45.4  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.761458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>