39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2671 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3053  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  83.84 
 
 		 792 aa  1363    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0646042 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2671  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  100 
 
 		 792 aa  1578    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342561  normal  0.283165 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  43.06 
 
 		 799 aa  557  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00111453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.38 
 
 		 745 aa  362  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0186966  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0009  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  28.11 
 
 		 684 aa  79.7  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3789  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.77 
 
 		 591 aa  74.7  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1610  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.82 
 
 		 964 aa  73.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3432  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.9 
 
 		 964 aa  72  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0164906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4245  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.21 
 
 		 1072 aa  71.6  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1023  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  28.36 
 
 		 636 aa  69.3  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2624  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  27.78 
 
 		 950 aa  67.4  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4840  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  30 
 
 		 277 aa  66.6  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5022  LGFP  30.73 
 
 		 537 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5403  LGFP repeat-containing protein  30.73 
 
 		 537 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.116536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5110  LGFP repeat-containing protein  30.73 
 
 		 537 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.667896 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1157  LGFP repeat-containing protein  28.21 
 
 		 541 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0583206  normal  0.0991304 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1925  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase  28.35 
 
 		 289 aa  62.4  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0536095  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2393  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  33.16 
 
 		 268 aa  62  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2719  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.33 
 
 		 274 aa  60.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4477  LGFP repeat-containing protein  28.84 
 
 		 370 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5652  LGFP repeat-containing protein  27.6 
 
 		 539 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.786051  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0417  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.34 
 
 		 905 aa  55.1  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.46141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13845  hypothetical protein  26.8 
 
 		 539 aa  54.7  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.280356 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3174  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.44 
 
 		 694 aa  54.3  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15405  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4329  LGFP repeat protein  27.18 
 
 		 928 aa  53.5  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.65 
 
 		 356 aa  53.9  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.72 
 
 		 959 aa  52.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3877  LGFP repeat protein  28.19 
 
 		 654 aa  51.2  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.200487  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34600  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.32 
 
 		 387 aa  50.8  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.123006  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1929  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  24.12 
 
 		 223 aa  49.7  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2379  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  27.21 
 
 		 879 aa  50.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0196  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  25.79 
 
 		 502 aa  49.3  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2558  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  23.96 
 
 		 728 aa  48.5  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.39914  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2816  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  24.31 
 
 		 542 aa  48.1  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1928  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  24.23 
 
 		 391 aa  47  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2561  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  23.67 
 
 		 784 aa  46.2  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4945  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  28.18 
 
 		 273 aa  45.4  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0099  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  26.8 
 
 		 552 aa  45.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1972  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  25.77 
 
 		 220 aa  45.1  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.289767  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>