40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0521 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0521  proliferating cell nuclear antigen PcnA  100 
 
 		 242 aa  482  1e-135  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0879  DNA polymerase sliding clamp  39.83 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2193  DNA polymerase sliding clamp  38.56 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1392  DNA polymerase sliding clamp  34.41 
 
 		 247 aa  155  7e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.529509  normal  0.388206 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4211  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  34.87 
 
 		 247 aa  151  7e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.379548  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1027  DNA polymerase sliding clamp  36.93 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.209457  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1253  DNA polymerase sliding clamp  34.03 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1488  DNA polymerase sliding clamp  34.87 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1463  DNA polymerase sliding clamp  32.79 
 
 		 247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0162  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  35.09 
 
 		 247 aa  139  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1013  proliferating cell nuclear antigen PcnA  34.29 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2041  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  34.21 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.710485  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2653  DNA polymerase sliding clamp  32.77 
 
 		 247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0986  proliferating cell nuclear antigen PcnA  32.81 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1695  monomeric DNA polymerase sliding clamp  32.81 
 
 		 250 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0699  proliferating cell nuclear antigen PcnA  35.92 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.695059  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0792  DNA polymerase sliding clamp  35 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0330065  normal  0.149639 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1648  DNA polymerase sliding clamp  31.14 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0960  proliferating cell nuclear antigen PcnA  32.81 
 
 		 250 aa  129  6e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.520524  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1015  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  33.33 
 
 		 261 aa  129  6e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.510505 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1755  proliferating cell nuclear antigen PcnA  29.83 
 
 		 248 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1682  proliferating cell nuclear antigen PcnA  30.86 
 
 		 249 aa  105  4e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.950147  normal  0.718796 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0438  proliferating cell nuclear antigen PcnA  30.86 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0624  proliferating cell nuclear antigen PcnA  30.45 
 
 		 247 aa  99.8  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1377  proliferating cell nuclear antigen PcnA  30.2 
 
 		 255 aa  95.9  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.163855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1788  proliferating cell nuclear antigen PcnA  27.98 
 
 		 249 aa  92.8  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0525119 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0042  proliferating cell nuclear antigen  25.81 
 
 		 293 aa  92.4  5e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.512471  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1383  proliferating cell nuclear antigen PcnA  26.97 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929046  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0990  monomeric DNA polymerase sliding clamp  27.87 
 
 		 265 aa  87  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2018  proliferating cell nuclear antigen PcnA  30.26 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41357  predicted protein  23.69 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0563637  normal  0.130673 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2250  DNA polymerase sliding clamp subunit A  24.79 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.151772 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2362  proliferating cell nuclear antigen  24.5 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29196  proliferating cell nuclear antigen  21.91 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1792  proliferating cell nuclear antigen  26.05 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2131  proliferating cell nuclear antigen  23.43 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80864  DNA polymerase delta processivity factor (proliferating cell nuclear antigen)  22.49 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1995  proliferating cell nuclear antigen  21.99 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0667  proliferating-cell nuclear antigen-like protein  24.38 
 
 		 256 aa  45.4  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.355101  normal  0.237552 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00880  DNA polymerase processivity factor, putative  25.42 
 
 		 343 aa  44.3  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>