54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_10955 on replicon BN001304
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001304  ANIA_10955  exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05560)  100 
 
 
299 aa  612  9.999999999999999e-175  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.606839  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53054  3'-5' exonuclease  45.9 
 
 
271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05710  MipD, putative  48.19 
 
 
417 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0879968  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13309  predicted protein  48.24 
 
 
182 aa  156  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0894911  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6857  predicted protein  45.25 
 
 
183 aa  146  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0261125  normal  0.0907147 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_8401  predicted protein  47.56 
 
 
167 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_4761  predicted protein  47.88 
 
 
163 aa  143  4e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000849222  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_5546  predicted protein  45.93 
 
 
172 aa  138  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15565  predicted protein  40.96 
 
 
168 aa  119  7.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0122539  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5177  predicted protein  31.88 
 
 
278 aa  108  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.617498 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38270  predicted protein  41.74 
 
 
583 aa  93.6  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61778  predicted protein  36.65 
 
 
645 aa  90.5  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.17866  normal  0.0618805 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40875  predicted protein  35.48 
 
 
189 aa  87.8  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0271597 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07566  exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14950)  35.45 
 
 
723 aa  87  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01700  hypothetical protein  32.89 
 
 
179 aa  85.9  7e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0544501  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02200  ribonuclease H, putative  35.88 
 
 
655 aa  79  0.00000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00500  3'-5' exonuclease, putative  36.02 
 
 
532 aa  72.8  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33043  predicted protein  32.08 
 
 
484 aa  72  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.804843  normal  0.549748 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6791  predicted protein  29.7 
 
 
228 aa  71.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_5333  predicted protein  35.76 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.684837 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04357  RNA exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00870)  31.18 
 
 
560 aa  70.1  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00340462  normal  0.927116 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42642  predicted protein  34.13 
 
 
696 aa  69.7  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517261  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46460  predicted protein  29.47 
 
 
1448 aa  64.7  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0697935  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44042  predicted protein  37.5 
 
 
578 aa  63.2  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.589194  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88597  predicted protein  30.69 
 
 
1183 aa  60.8  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.713267  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05013  RNA exonuclease 3 (EC 3.1.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B367]  28.71 
 
 
638 aa  60.5  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0524  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.59 
 
 
835 aa  52.8  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00517102  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.53 
 
 
927 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44363  predicted protein  27.22 
 
 
508 aa  50.4  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148061  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04900  conserved hypothetical protein  29.41 
 
 
1183 aa  50.4  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.427211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3297  DNA polymerase III subunit epsilon  24.42 
 
 
315 aa  50.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  23.64 
 
 
1433 aa  47.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  24.85 
 
 
315 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.42 
 
 
930 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  24.26 
 
 
315 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  24.26 
 
 
315 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  24.26 
 
 
315 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  24.26 
 
 
315 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0503  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.21 
 
 
695 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0629426  normal  0.16655 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1750  DNA polymerase III subunit epsilon  27.43 
 
 
195 aa  45.8  0.0009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0163231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  23.67 
 
 
315 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  24.26 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  24.26 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6889  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  25 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.796423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  23.67 
 
 
315 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0301  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.14 
 
 
236 aa  44.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.72 
 
 
934 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0572  putative exonuclease  31.25 
 
 
695 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16617  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02065  PAB-dependent poly(A)-specific ribonuclease subunit pan2 (EC 3.1.13.4)(PAB1P-dependent poly(A)-nuclease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBL5]  27.95 
 
 
1154 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2572  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.9 
 
 
476 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378709  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2225  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.25 
 
 
695 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.616046  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4419  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.03 
 
 
224 aa  43.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280676  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  24.03 
 
 
929 aa  43.5  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  25 
 
 
1362 aa  42.4  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>