70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC05710 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC05710  MipD, putative  100 
 
 		 417 aa  855    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0879968  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53054  3'-5' exonuclease  56.02 
 
 		 271 aa  204  3e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10955  exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05560)  37.11 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.606839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6857  predicted protein  47.49 
 
 		 183 aa  152  8.999999999999999e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0261125  normal  0.0907147 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13309  predicted protein  45.35 
 
 		 182 aa  143  4e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0894911  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_5546  predicted protein  41.86 
 
 		 172 aa  139  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_4761  predicted protein  45.73 
 
 		 163 aa  132  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000849222  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_8401  predicted protein  39.88 
 
 		 167 aa  123  6e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15565  predicted protein  39.16 
 
 		 168 aa  116  6e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0122539  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01700  hypothetical protein  35.29 
 
 		 179 aa  102  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0544501  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5177  predicted protein  36.26 
 
 		 278 aa  99  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.617498 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38270  predicted protein  34.68 
 
 		 583 aa  98.2  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07566  exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14950)  35.9 
 
 		 723 aa  85.5  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40875  predicted protein  33.97 
 
 		 189 aa  78.6  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0271597 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61778  predicted protein  29.88 
 
 		 645 aa  76.6  0.0000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.17866  normal  0.0618805 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33043  predicted protein  31.79 
 
 		 484 aa  72  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.804843  normal  0.549748 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6791  predicted protein  31.67 
 
 		 228 aa  69.3  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04357  RNA exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00870)  34.52 
 
 		 560 aa  68.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00340462  normal  0.927116 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02200  ribonuclease H, putative  35.29 
 
 		 655 aa  66.6  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_5333  predicted protein  32.7 
 
 		 369 aa  66.2  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.684837 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44042  predicted protein  39.62 
 
 		 578 aa  65.1  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.589194  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00500  3'-5' exonuclease, putative  30.06 
 
 		 532 aa  62  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6889  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  32.18 
 
 		 293 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.796423  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46460  predicted protein  26.06 
 
 		 1448 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0697935  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.85 
 
 		 927 aa  56.6  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42642  predicted protein  30.49 
 
 		 696 aa  57  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517261  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88597  predicted protein  27.32 
 
 		 1183 aa  56.6  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.713267  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04900  conserved hypothetical protein  29.67 
 
 		 1183 aa  55.8  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.427211  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.95 
 
 		 934 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02065  PAB-dependent poly(A)-specific ribonuclease subunit pan2 (EC 3.1.13.4)(PAB1P-dependent poly(A)-nuclease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBL5]  27 
 
 		 1154 aa  54.3  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3297  DNA polymerase III subunit epsilon  24.86 
 
 		 315 aa  53.5  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5498  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.17 
 
 		 456 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  decreased coverage  0.000256581 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  22.17 
 
 		 315 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0076  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.17 
 
 		 442 aa  51.2  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  24.28 
 
 		 315 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  24.28 
 
 		 315 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44363  predicted protein  25 
 
 		 508 aa  51.2  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148061  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  30 
 
 		 944 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  23.15 
 
 		 315 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  24.28 
 
 		 315 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  24.28 
 
 		 315 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  23.7 
 
 		 315 aa  49.7  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0524  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  28.74 
 
 		 835 aa  49.7  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00517102  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  23.7 
 
 		 315 aa  49.7  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0503  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.36 
 
 		 695 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0629426  normal  0.16655 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05013  RNA exonuclease 3 (EC 3.1.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B367]  30.48 
 
 		 638 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2342  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.17 
 
 		 201 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.944243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  27.23 
 
 		 1435 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.17 
 
 		 956 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.64 
 
 		 921 aa  47.8  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  25.64 
 
 		 590 aa  47.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  23.7 
 
 		 315 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3499  exonuclease  26.04 
 
 		 198 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108148  hitchhiker  4.31103e-25 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2053  putative PAS/PAC sensor protein  22.22 
 
 		 714 aa  47  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115114 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09513  probable DNA-directed DNA polymerase III (epsilon subunit)  26.04 
 
 		 457 aa  46.6  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3451  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.04 
 
 		 453 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2656  DNA polymerase III, epsilon subunit  25 
 
 		 456 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.60887 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.12 
 
 		 960 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2225  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.93 
 
 		 695 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.616046  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0572  putative exonuclease  27.93 
 
 		 695 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16617  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0504  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  23.96 
 
 		 909 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2250  hypothetical protein  27.08 
 
 		 242 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.08 
 
 		 565 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1750  DNA polymerase III subunit epsilon  24.75 
 
 		 195 aa  45.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0163231  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2319  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.04 
 
 		 217 aa  45.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127163  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1965  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.71 
 
 		 459 aa  43.9  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249813  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3518  hypothetical protein  27.84 
 
 		 585 aa  43.9  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.663453  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2347  exonuclease  25 
 
 		 313 aa  43.9  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2024  Rad3-related DNA helicase  28.41 
 
 		 791 aa  43.5  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.323186  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2204  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.6 
 
 		 252 aa  43.5  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>