24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_88597 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_88597  predicted protein  100 
 
 		 1183 aa  2434    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.713267  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02065  PAB-dependent poly(A)-specific ribonuclease subunit pan2 (EC 3.1.13.4)(PAB1P-dependent poly(A)-nuclease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBL5]  30.26 
 
 		 1154 aa  504  1e-141  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04900  conserved hypothetical protein  39.95 
 
 		 1183 aa  265  4.999999999999999e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.427211  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6791  predicted protein  47.66 
 
 		 228 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46460  predicted protein  34.52 
 
 		 1448 aa  157  8e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0697935  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07566  exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14950)  34.44 
 
 		 723 aa  63.9  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6857  predicted protein  29.59 
 
 		 183 aa  63.2  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0261125  normal  0.0907147 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_4761  predicted protein  31.32 
 
 		 163 aa  62.8  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000849222  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_5333  predicted protein  30.92 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.684837 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10955  exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05560)  30.69 
 
 		 299 aa  60.8  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.606839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40875  predicted protein  30.34 
 
 		 189 aa  59.3  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0271597 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00500  3'-5' exonuclease, putative  28.48 
 
 		 532 aa  58.2  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15565  predicted protein  34.78 
 
 		 168 aa  56.2  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0122539  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05710  MipD, putative  27.32 
 
 		 417 aa  56.6  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0879968  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_8401  predicted protein  32.23 
 
 		 167 aa  55.8  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44042  predicted protein  29.19 
 
 		 578 aa  55.8  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.589194  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53054  3'-5' exonuclease  26.06 
 
 		 271 aa  55.5  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33043  predicted protein  30.91 
 
 		 484 aa  54.3  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.804843  normal  0.549748 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42642  predicted protein  30.41 
 
 		 696 aa  53.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517261  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13309  predicted protein  29.41 
 
 		 182 aa  50.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0894911  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38270  predicted protein  32.32 
 
 		 583 aa  50.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61778  predicted protein  29.41 
 
 		 645 aa  49.7  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.17866  normal  0.0618805 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_5546  predicted protein  31.65 
 
 		 172 aa  48.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02200  ribonuclease H, putative  28.88 
 
 		 655 aa  47  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>