28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_61778 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_61778  predicted protein  100 
 
 
645 aa  1327    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.17866  normal  0.0618805 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07566  exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14950)  32.32 
 
 
723 aa  222  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02200  ribonuclease H, putative  27.73 
 
 
655 aa  207  4e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40875  predicted protein  43.65 
 
 
189 aa  148  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0271597 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42642  predicted protein  38.51 
 
 
696 aa  115  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517261  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00500  3'-5' exonuclease, putative  32.52 
 
 
532 aa  106  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33043  predicted protein  28.89 
 
 
484 aa  105  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.804843  normal  0.549748 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_5333  predicted protein  38.31 
 
 
369 aa  101  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.684837 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05013  RNA exonuclease 3 (EC 3.1.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B367]  30.69 
 
 
638 aa  93.2  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10955  exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05560)  36.65 
 
 
299 aa  90.5  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.606839  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44042  predicted protein  28.89 
 
 
578 aa  90.1  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.589194  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53054  3'-5' exonuclease  31.55 
 
 
271 aa  86.7  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05710  MipD, putative  29.88 
 
 
417 aa  76.3  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0879968  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6857  predicted protein  33.71 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0261125  normal  0.0907147 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15565  predicted protein  33.95 
 
 
168 aa  73.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0122539  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13309  predicted protein  31.52 
 
 
182 aa  71.2  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0894911  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04357  RNA exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00870)  23.74 
 
 
560 aa  70.5  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00340462  normal  0.927116 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_4761  predicted protein  31.71 
 
 
163 aa  70.1  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000849222  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5177  predicted protein  32.1 
 
 
278 aa  68.9  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.617498 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_5546  predicted protein  32.93 
 
 
172 aa  67.8  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02065  PAB-dependent poly(A)-specific ribonuclease subunit pan2 (EC 3.1.13.4)(PAB1P-dependent poly(A)-nuclease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBL5]  31.79 
 
 
1154 aa  59.3  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6791  predicted protein  28.57 
 
 
228 aa  58.5  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46460  predicted protein  26.85 
 
 
1448 aa  58.5  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0697935  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38270  predicted protein  29.23 
 
 
583 aa  58.5  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04900  conserved hypothetical protein  28.29 
 
 
1183 aa  57.8  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.427211  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_8401  predicted protein  28.66 
 
 
167 aa  57.4  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01700  hypothetical protein  28.99 
 
 
179 aa  55.5  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0544501  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88597  predicted protein  29.41 
 
 
1183 aa  49.7  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.713267  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>