27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN02200 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006683  CNN02200  ribonuclease H, putative  100 
 
 		 655 aa  1357    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07566  exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14950)  28.35 
 
 		 723 aa  246  9.999999999999999e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61778  predicted protein  27.35 
 
 		 645 aa  208  2e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.17866  normal  0.0618805 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40875  predicted protein  42.7 
 
 		 189 aa  134  6e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0271597 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_5333  predicted protein  42.77 
 
 		 369 aa  120  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.684837 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05013  RNA exonuclease 3 (EC 3.1.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B367]  39.78 
 
 		 638 aa  117  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42642  predicted protein  40.57 
 
 		 696 aa  114  7.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517261  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00500  3'-5' exonuclease, putative  37.42 
 
 		 532 aa  109  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33043  predicted protein  40.13 
 
 		 484 aa  107  7e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.804843  normal  0.549748 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44042  predicted protein  30 
 
 		 578 aa  79.7  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.589194  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10955  exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05560)  35.63 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.606839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53054  3'-5' exonuclease  33.13 
 
 		 271 aa  72  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6857  predicted protein  35.36 
 
 		 183 aa  71.6  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0261125  normal  0.0907147 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13309  predicted protein  35.71 
 
 		 182 aa  70.5  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0894911  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05710  MipD, putative  35.29 
 
 		 417 aa  66.6  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0879968  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15565  predicted protein  34.15 
 
 		 168 aa  65.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0122539  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04357  RNA exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00870)  27.43 
 
 		 560 aa  63.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00340462  normal  0.927116 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_8401  predicted protein  32.54 
 
 		 167 aa  59.7  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_5546  predicted protein  33.73 
 
 		 172 aa  58.9  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04900  conserved hypothetical protein  32.45 
 
 		 1183 aa  57  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.427211  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5177  predicted protein  32.32 
 
 		 278 aa  55.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.617498 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38270  predicted protein  35.78 
 
 		 583 aa  55.1  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46460  predicted protein  29.83 
 
 		 1448 aa  51.6  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0697935  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_4761  predicted protein  32.92 
 
 		 163 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000849222  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88597  predicted protein  28.88 
 
 		 1183 aa  47.4  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.713267  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02065  PAB-dependent poly(A)-specific ribonuclease subunit pan2 (EC 3.1.13.4)(PAB1P-dependent poly(A)-nuclease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBL5]  27.14 
 
 		 1154 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01700  hypothetical protein  30.67 
 
 		 179 aa  43.9  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0544501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>