32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_53054 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_53054  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 271 aa  553  1e-156  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10955  exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05560)  45.39 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.606839  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05710  MipD, putative  56.02 
 
 		 417 aa  204  1e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0879968  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13309  predicted protein  48.59 
 
 		 182 aa  159  6e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0894911  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6857  predicted protein  42.46 
 
 		 183 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0261125  normal  0.0907147 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_5546  predicted protein  40.94 
 
 		 172 aa  131  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_4761  predicted protein  46.34 
 
 		 163 aa  129  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000849222  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_8401  predicted protein  40.49 
 
 		 167 aa  122  9e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15565  predicted protein  37.58 
 
 		 168 aa  115  7.999999999999999e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0122539  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38270  predicted protein  42.86 
 
 		 583 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01700  hypothetical protein  34.9 
 
 		 179 aa  97.4  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0544501  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07566  exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14950)  39.51 
 
 		 723 aa  94.7  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5177  predicted protein  31.84 
 
 		 278 aa  91.7  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.617498 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61778  predicted protein  31.55 
 
 		 645 aa  87  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.17866  normal  0.0618805 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40875  predicted protein  33.99 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0271597 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6791  predicted protein  29.85 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_5333  predicted protein  36.6 
 
 		 369 aa  72.4  0.000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.684837 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02200  ribonuclease H, putative  33.13 
 
 		 655 aa  72  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04357  RNA exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00870)  34.52 
 
 		 560 aa  69.3  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00340462  normal  0.927116 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00500  3'-5' exonuclease, putative  29.09 
 
 		 532 aa  68.2  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33043  predicted protein  31.58 
 
 		 484 aa  68.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.804843  normal  0.549748 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42642  predicted protein  32.75 
 
 		 696 aa  63.5  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517261  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46460  predicted protein  32.58 
 
 		 1448 aa  61.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0697935  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44042  predicted protein  31.37 
 
 		 578 aa  56.6  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.589194  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88597  predicted protein  26.06 
 
 		 1183 aa  55.1  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.713267  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05013  RNA exonuclease 3 (EC 3.1.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B367]  31.35 
 
 		 638 aa  53.9  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02065  PAB-dependent poly(A)-specific ribonuclease subunit pan2 (EC 3.1.13.4)(PAB1P-dependent poly(A)-nuclease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBL5]  25.77 
 
 		 1154 aa  52.4  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04900  conserved hypothetical protein  25.93 
 
 		 1183 aa  52.4  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.427211  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.44 
 
 		 927 aa  49.7  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 		 934 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0076  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.33 
 
 		 442 aa  47.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.41 
 
 		 921 aa  43.5  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>