25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_8401 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009356  OSTLU_8401  predicted protein  100 
 
 
167 aa  347  5e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10955  exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05560)  47.56 
 
 
299 aa  146  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.606839  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6857  predicted protein  45.25 
 
 
183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0261125  normal  0.0907147 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13309  predicted protein  41.82 
 
 
182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0894911  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_4761  predicted protein  44.24 
 
 
163 aa  134  5e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000849222  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_5546  predicted protein  42.51 
 
 
172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05710  MipD, putative  39.88 
 
 
417 aa  123  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0879968  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53054  3'-5' exonuclease  40.49 
 
 
271 aa  122  3e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15565  predicted protein  37.13 
 
 
168 aa  97.1  9e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0122539  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38270  predicted protein  34.1 
 
 
583 aa  89.4  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5177  predicted protein  32.16 
 
 
278 aa  85.1  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.617498 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01700  hypothetical protein  34.67 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0544501  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07566  exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14950)  34.16 
 
 
723 aa  67.4  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40875  predicted protein  32.9 
 
 
189 aa  67.4  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0271597 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_5333  predicted protein  33.95 
 
 
369 aa  63.5  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.684837 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42642  predicted protein  33.13 
 
 
696 aa  62.8  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517261  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6791  predicted protein  31.79 
 
 
228 aa  60.8  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02200  ribonuclease H, putative  32.54 
 
 
655 aa  59.7  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00500  3'-5' exonuclease, putative  31.95 
 
 
532 aa  57.8  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61778  predicted protein  28.66 
 
 
645 aa  57.4  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.17866  normal  0.0618805 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88597  predicted protein  32.23 
 
 
1183 aa  55.8  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.713267  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33043  predicted protein  25.9 
 
 
484 aa  50.8  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.804843  normal  0.549748 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04357  RNA exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00870)  30.25 
 
 
560 aa  49.3  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00340462  normal  0.927116 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02065  PAB-dependent poly(A)-specific ribonuclease subunit pan2 (EC 3.1.13.4)(PAB1P-dependent poly(A)-nuclease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBL5]  29.11 
 
 
1154 aa  45.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44042  predicted protein  27.88 
 
 
578 aa  41.6  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.589194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>