28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_4761 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_4761  predicted protein  100 
 
 
163 aa  342  2e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000849222  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13309  predicted protein  47.59 
 
 
182 aa  155  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0894911  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6857  predicted protein  45.4 
 
 
183 aa  143  8.000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0261125  normal  0.0907147 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10955  exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05560)  47.88 
 
 
299 aa  142  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.606839  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_5546  predicted protein  47.9 
 
 
172 aa  141  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_8401  predicted protein  44.24 
 
 
167 aa  134  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15565  predicted protein  46.11 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0122539  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05710  MipD, putative  45.12 
 
 
417 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0879968  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53054  3'-5' exonuclease  46.34 
 
 
271 aa  129  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38270  predicted protein  36.63 
 
 
583 aa  106  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01700  hypothetical protein  32.24 
 
 
179 aa  85.1  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0544501  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5177  predicted protein  32.75 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.617498 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61778  predicted protein  31.71 
 
 
645 aa  70.1  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.17866  normal  0.0618805 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6791  predicted protein  31.28 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40875  predicted protein  32.47 
 
 
189 aa  63.9  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0271597 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46460  predicted protein  33.52 
 
 
1448 aa  63.9  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0697935  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07566  exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14950)  32.95 
 
 
723 aa  63.2  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00500  3'-5' exonuclease, putative  34.57 
 
 
532 aa  63.2  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88597  predicted protein  31.32 
 
 
1183 aa  62.8  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.713267  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42642  predicted protein  33.73 
 
 
696 aa  61.2  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517261  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44363  predicted protein  28.19 
 
 
508 aa  60.8  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148061  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44042  predicted protein  32.28 
 
 
578 aa  58.9  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.589194  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02065  PAB-dependent poly(A)-specific ribonuclease subunit pan2 (EC 3.1.13.4)(PAB1P-dependent poly(A)-nuclease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBL5]  33.33 
 
 
1154 aa  56.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04900  conserved hypothetical protein  30.2 
 
 
1183 aa  55.5  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.427211  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33043  predicted protein  27.85 
 
 
484 aa  55.5  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.804843  normal  0.549748 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_5333  predicted protein  30.38 
 
 
369 aa  53.1  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.684837 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04357  RNA exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00870)  35.78 
 
 
560 aa  52  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00340462  normal  0.927116 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02200  ribonuclease H, putative  32.92 
 
 
655 aa  50.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>