21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND04900 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND04900  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 1183 aa  2443    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.427211  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02065  PAB-dependent poly(A)-specific ribonuclease subunit pan2 (EC 3.1.13.4)(PAB1P-dependent poly(A)-nuclease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBL5]  34.76 
 
 		 1154 aa  600  1e-170  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88597  predicted protein  40.2 
 
 		 1183 aa  267  1e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.713267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6791  predicted protein  52.78 
 
 		 228 aa  209  3e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46460  predicted protein  37.46 
 
 		 1448 aa  189  4e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0697935  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07566  exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14950)  35.62 
 
 		 723 aa  73.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6857  predicted protein  30.81 
 
 		 183 aa  61.6  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0261125  normal  0.0907147 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61778  predicted protein  28.29 
 
 		 645 aa  57.8  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.17866  normal  0.0618805 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42642  predicted protein  29.44 
 
 		 696 aa  57.4  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517261  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00500  3'-5' exonuclease, putative  24.66 
 
 		 532 aa  58.2  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02200  ribonuclease H, putative  32.45 
 
 		 655 aa  57  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05710  MipD, putative  28.36 
 
 		 417 aa  55.5  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0879968  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_4761  predicted protein  30.2 
 
 		 163 aa  55.5  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000849222  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15565  predicted protein  32.11 
 
 		 168 aa  55.1  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0122539  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40875  predicted protein  28.57 
 
 		 189 aa  55.1  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0271597 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53054  3'-5' exonuclease  25.93 
 
 		 271 aa  51.6  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_5333  predicted protein  29.41 
 
 		 369 aa  51.2  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.684837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  20.93 
 
 		 1831 aa  50.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10955  exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05560)  28.67 
 
 		 299 aa  50.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.606839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33043  predicted protein  31.29 
 
 		 484 aa  49.3  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.804843  normal  0.549748 
 
 
-
 
NC_006686  CND02860  WD-repeat protein, putative  22.76 
 
 		 899 aa  45.1  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.462814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>