25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_44042 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_44042  predicted protein  100 
 
 
578 aa  1201    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.589194  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33043  predicted protein  31.19 
 
 
484 aa  124  5e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.804843  normal  0.549748 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07566  exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14950)  34.43 
 
 
723 aa  105  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61778  predicted protein  28.89 
 
 
645 aa  90.1  9e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.17866  normal  0.0618805 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40875  predicted protein  32.7 
 
 
189 aa  87.4  6e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0271597 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00500  3'-5' exonuclease, putative  31.95 
 
 
532 aa  84.7  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_5333  predicted protein  32.02 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.684837 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02200  ribonuclease H, putative  30 
 
 
655 aa  78.2  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42642  predicted protein  33.1 
 
 
696 aa  77.4  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517261  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04357  RNA exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00870)  29.51 
 
 
560 aa  65.5  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00340462  normal  0.927116 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05710  MipD, putative  39.62 
 
 
417 aa  65.1  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0879968  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10955  exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05560)  37.5 
 
 
299 aa  63.2  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.606839  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_4761  predicted protein  32.28 
 
 
163 aa  60.1  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000849222  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_5546  predicted protein  31.95 
 
 
172 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13309  predicted protein  36.45 
 
 
182 aa  57.4  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0894911  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46460  predicted protein  29.88 
 
 
1448 aa  57.4  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0697935  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88597  predicted protein  29.19 
 
 
1183 aa  56.6  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.713267  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38270  predicted protein  35.11 
 
 
583 aa  56.6  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6791  predicted protein  27.22 
 
 
228 aa  55.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15565  predicted protein  33.13 
 
 
168 aa  55.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0122539  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53054  3'-5' exonuclease  31.37 
 
 
271 aa  55.1  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05013  RNA exonuclease 3 (EC 3.1.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B367]  26.07 
 
 
638 aa  53.9  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88691  predicted protein  26.16 
 
 
234 aa  53.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6857  predicted protein  25.28 
 
 
183 aa  48.9  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0261125  normal  0.0907147 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01700  hypothetical protein  31.08 
 
 
179 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0544501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>