44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_15565 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_15565  predicted protein  100 
 
 		 168 aa  350  5e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0122539  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_5546  predicted protein  55.03 
 
 		 172 aa  180  7e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13309  predicted protein  43.45 
 
 		 182 aa  135  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0894911  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_4761  predicted protein  46.11 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000849222  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10955  exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05560)  40.96 
 
 		 299 aa  119  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.606839  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05710  MipD, putative  38.92 
 
 		 417 aa  116  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0879968  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53054  3'-5' exonuclease  37.58 
 
 		 271 aa  115  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38270  predicted protein  38.8 
 
 		 583 aa  111  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6857  predicted protein  36.31 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0261125  normal  0.0907147 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_8401  predicted protein  37.13 
 
 		 167 aa  97.1  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5177  predicted protein  35.06 
 
 		 278 aa  90.1  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.617498 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00500  3'-5' exonuclease, putative  42.41 
 
 		 532 aa  88.6  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07566  exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14950)  36.54 
 
 		 723 aa  80.9  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01700  hypothetical protein  32.21 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0544501  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61778  predicted protein  33.95 
 
 		 645 aa  73.2  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.17866  normal  0.0618805 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33043  predicted protein  35.12 
 
 		 484 aa  67.4  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.804843  normal  0.549748 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02200  ribonuclease H, putative  34.15 
 
 		 655 aa  65.9  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42642  predicted protein  32.74 
 
 		 696 aa  65.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517261  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44363  predicted protein  28.99 
 
 		 508 aa  64.7  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148061  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_5333  predicted protein  32.26 
 
 		 369 aa  62.4  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.684837 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40875  predicted protein  33.55 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0271597 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44042  predicted protein  33.13 
 
 		 578 aa  57  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.589194  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88597  predicted protein  34.78 
 
 		 1183 aa  56.2  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.713267  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04357  RNA exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00870)  29.89 
 
 		 560 aa  56.6  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00340462  normal  0.927116 
 
 
-
 
NC_006686  CND04900  conserved hypothetical protein  32.11 
 
 		 1183 aa  55.1  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.427211  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6791  predicted protein  34.46 
 
 		 228 aa  54.3  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02065  PAB-dependent poly(A)-specific ribonuclease subunit pan2 (EC 3.1.13.4)(PAB1P-dependent poly(A)-nuclease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBL5]  28.07 
 
 		 1154 aa  50.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05013  RNA exonuclease 3 (EC 3.1.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B367]  29.57 
 
 		 638 aa  46.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  24.71 
 
 		 315 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6889  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  29.73 
 
 		 293 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.796423  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  24.71 
 
 		 315 aa  44.3  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  24.56 
 
 		 315 aa  44.3  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46460  predicted protein  26.88 
 
 		 1448 aa  44.3  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0697935  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  24.71 
 
 		 315 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  24.71 
 
 		 315 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  24.71 
 
 		 315 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.66 
 
 		 927 aa  42.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88691  predicted protein  28.57 
 
 		 234 aa  42.4  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5498  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.56 
 
 		 456 aa  42  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  decreased coverage  0.000256581 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  24.12 
 
 		 315 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  24.12 
 
 		 315 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3297  DNA polymerase III subunit epsilon  24.71 
 
 		 315 aa  41.2  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  24.12 
 
 		 315 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1965  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.88 
 
 		 459 aa  40.8  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>