21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_02065 on replicon BN001307
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_02065  PAB-dependent poly(A)-specific ribonuclease subunit pan2 (EC 3.1.13.4)(PAB1P-dependent poly(A)-nuclease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBL5]  100 
 
 
1154 aa  2404    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04900  conserved hypothetical protein  34.43 
 
 
1183 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.427211  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88597  predicted protein  30.26 
 
 
1183 aa  504  1e-141  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.713267  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6791  predicted protein  45.5 
 
 
228 aa  193  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46460  predicted protein  31.37 
 
 
1448 aa  169  2.9999999999999998e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0697935  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07566  exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14950)  33.33 
 
 
723 aa  79.7  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00500  3'-5' exonuclease, putative  30.82 
 
 
532 aa  71.2  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61778  predicted protein  31.79 
 
 
645 aa  59.3  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.17866  normal  0.0618805 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6857  predicted protein  29.5 
 
 
183 aa  56.6  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0261125  normal  0.0907147 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_4761  predicted protein  33.33 
 
 
163 aa  56.2  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000849222  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42642  predicted protein  30.72 
 
 
696 aa  56.2  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517261  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05710  MipD, putative  27 
 
 
417 aa  53.9  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0879968  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53054  3'-5' exonuclease  25.77 
 
 
271 aa  52.4  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15565  predicted protein  28.07 
 
 
168 aa  50.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0122539  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5177  predicted protein  26.06 
 
 
278 aa  48.5  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.617498 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05013  RNA exonuclease 3 (EC 3.1.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B367]  37.04 
 
 
638 aa  48.1  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13309  predicted protein  26.11 
 
 
182 aa  48.1  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0894911  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02200  ribonuclease H, putative  27.14 
 
 
655 aa  46.2  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01700  hypothetical protein  27.54 
 
 
179 aa  45.8  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0544501  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_8401  predicted protein  29.11 
 
 
167 aa  45.4  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10955  exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05560)  27.95 
 
 
299 aa  44.7  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.606839  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>