26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_40875 on replicon NC_009360
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009360  OSTLU_40875  predicted protein  100 
 
 
189 aa  390  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0271597 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07566  exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14950)  51.63 
 
 
723 aa  160  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61778  predicted protein  43.65 
 
 
645 aa  148  4e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.17866  normal  0.0618805 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02200  ribonuclease H, putative  42.7 
 
 
655 aa  134  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00500  3'-5' exonuclease, putative  41.67 
 
 
532 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33043  predicted protein  42.21 
 
 
484 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.804843  normal  0.549748 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42642  predicted protein  41.88 
 
 
696 aa  107  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517261  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_5333  predicted protein  36.25 
 
 
369 aa  104  7e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.684837 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05013  RNA exonuclease 3 (EC 3.1.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B367]  35.91 
 
 
638 aa  96.7  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10955  exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05560)  35.48 
 
 
299 aa  88.2  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.606839  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44042  predicted protein  32.7 
 
 
578 aa  87.8  9e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.589194  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6857  predicted protein  36.9 
 
 
183 aa  87.8  9e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0261125  normal  0.0907147 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13309  predicted protein  36.31 
 
 
182 aa  87  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0894911  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53054  3'-5' exonuclease  33.99 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05710  MipD, putative  33.97 
 
 
417 aa  78.6  0.00000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0879968  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5177  predicted protein  34.32 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.617498 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_8401  predicted protein  32.9 
 
 
167 aa  67.4  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_4761  predicted protein  32.47 
 
 
163 aa  63.9  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000849222  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46460  predicted protein  31.88 
 
 
1448 aa  61.6  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0697935  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15565  predicted protein  33.55 
 
 
168 aa  61.6  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0122539  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04357  RNA exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00870)  27.23 
 
 
560 aa  59.7  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00340462  normal  0.927116 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88597  predicted protein  30.34 
 
 
1183 aa  59.3  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.713267  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6791  predicted protein  29.17 
 
 
228 aa  57.8  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04900  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
1183 aa  55.1  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.427211  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_5546  predicted protein  28.93 
 
 
172 aa  54.3  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01700  hypothetical protein  29.66 
 
 
179 aa  54.3  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0544501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>