29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_13309 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_13309  predicted protein  100 
 
 		 182 aa  375  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0894911  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53054  3'-5' exonuclease  48.59 
 
 		 271 aa  159  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_5546  predicted protein  47.09 
 
 		 172 aa  157  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10955  exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05560)  48.24 
 
 		 299 aa  156  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.606839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_4761  predicted protein  47.59 
 
 		 163 aa  155  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000849222  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6857  predicted protein  46.41 
 
 		 183 aa  151  4e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0261125  normal  0.0907147 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05710  MipD, putative  45.35 
 
 		 417 aa  143  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0879968  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_8401  predicted protein  41.82 
 
 		 167 aa  139  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15565  predicted protein  43.45 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0122539  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38270  predicted protein  39.11 
 
 		 583 aa  120  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5177  predicted protein  34.48 
 
 		 278 aa  97.8  8e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.617498 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07566  exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14950)  38.61 
 
 		 723 aa  87.4  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00500  3'-5' exonuclease, putative  37.27 
 
 		 532 aa  87.4  9e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40875  predicted protein  36.31 
 
 		 189 aa  87  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0271597 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01700  hypothetical protein  31.87 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0544501  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33043  predicted protein  32.72 
 
 		 484 aa  72.8  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.804843  normal  0.549748 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61778  predicted protein  31.52 
 
 		 645 aa  71.2  0.000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.17866  normal  0.0618805 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05013  RNA exonuclease 3 (EC 3.1.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B367]  33.33 
 
 		 638 aa  70.9  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02200  ribonuclease H, putative  35.71 
 
 		 655 aa  70.5  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42642  predicted protein  34.34 
 
 		 696 aa  61.2  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517261  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_5333  predicted protein  33.12 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.684837 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44042  predicted protein  36.45 
 
 		 578 aa  57.8  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.589194  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04357  RNA exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00870)  32.74 
 
 		 560 aa  53.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00340462  normal  0.927116 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6791  predicted protein  27.72 
 
 		 228 aa  52  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88597  predicted protein  29.41 
 
 		 1183 aa  50.8  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.713267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44363  predicted protein  27.17 
 
 		 508 aa  51.2  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148061  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02065  PAB-dependent poly(A)-specific ribonuclease subunit pan2 (EC 3.1.13.4)(PAB1P-dependent poly(A)-nuclease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBL5]  26.11 
 
 		 1154 aa  48.1  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46460  predicted protein  28.29 
 
 		 1448 aa  45.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0697935  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04900  conserved hypothetical protein  24.73 
 
 		 1183 aa  41.2  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.427211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>