More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_02989 on replicon BN001306
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001306  ANIA_02989  glycine-rich RNA-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08580)  100 
 
 
128 aa  260  4.999999999999999e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0108473  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  53.75 
 
 
182 aa  98.6  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  55 
 
 
125 aa  90.5  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  43.75 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  45.45 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  43.02 
 
 
90 aa  77.8  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  46.99 
 
 
162 aa  77.4  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  43.02 
 
 
90 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  37.5 
 
 
119 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  41.98 
 
 
82 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0321  hypothetical protein  43.04 
 
 
91 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
102 aa  73.9  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
102 aa  73.9  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  46.75 
 
 
95 aa  73.2  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  43.01 
 
 
524 aa  72.4  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  38.67 
 
 
90 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  51.22 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  43.42 
 
 
148 aa  72  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  40 
 
 
114 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  43.42 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  44.74 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10941  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein HRP1 (AFU_orthologue; AFUA_2G06090)  43.04 
 
 
559 aa  71.2  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210274  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  43.42 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2518  RNP-1-like RNA-binding protein  42.17 
 
 
85 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0020786  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  38.95 
 
 
116 aa  71.2  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  43.42 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  42.11 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  42.47 
 
 
99 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  44.74 
 
 
123 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  43.42 
 
 
176 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  38.82 
 
 
90 aa  70.1  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  37.86 
 
 
105 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  42.11 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0401  RNP-1 like RNA-binding protein  44.3 
 
 
92 aa  69.7  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000557638  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  40 
 
 
99 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  37.63 
 
 
98 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  36.84 
 
 
90 aa  69.7  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  41.03 
 
 
101 aa  70.1  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  43.42 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  37.63 
 
 
98 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  43.42 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  43.42 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  37.65 
 
 
90 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  43.42 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  42.11 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  43.42 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  38.71 
 
 
115 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  43.37 
 
 
88 aa  68.2  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  38.82 
 
 
89 aa  68.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  41.18 
 
 
102 aa  68.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  41.98 
 
 
207 aa  67.8  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  42.11 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  41.46 
 
 
88 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12693  predicted protein  38.96 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689101  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  41.03 
 
 
107 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  41.03 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0338  RNA-binding protein  39.24 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  36.9 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3309  RNP-1 like RNA-binding protein  44.3 
 
 
82 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788689  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  40.79 
 
 
90 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  40.24 
 
 
81 aa  67  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  39.74 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2980  RNP-1 like RNA-binding protein  35.96 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0728065  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  41.25 
 
 
85 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  39.74 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  39.51 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  37.65 
 
 
94 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  37.65 
 
 
94 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  37.33 
 
 
95 aa  65.5  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  42.86 
 
 
87 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  43.84 
 
 
441 aa  65.5  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  38.36 
 
 
90 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0356  RNA recognition motif-containing protein  40.79 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0992503  normal  0.0823842 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21039  predicted protein  39.24 
 
 
246 aa  65.1  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  39.76 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  43.04 
 
 
91 aa  65.5  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55837  predicted protein  38.46 
 
 
453 aa  65.1  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.876442  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  39.51 
 
 
87 aa  65.5  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  40.79 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  36.67 
 
 
95 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4127  RNP-1 like RNA-binding protein  40.79 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15501  RNA-binding protein RbpD  38.46 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1603  RNP-1 like RNA-binding protein  42.5 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2194  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
101 aa  63.9  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  42.31 
 
 
88 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1867  RNP1-like RNA-binding protein  43.59 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000148151  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0508  nicotinate phosphoribosyltransferase  45.9 
 
 
65 aa  63.5  0.0000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  35.9 
 
 
101 aa  63.5  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  34.41 
 
 
114 aa  63.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05240  mRNA catabolism, nonsense-mediated-related protein, putative  35.9 
 
 
434 aa  62.8  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115659  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  37.33 
 
 
111 aa  63.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  37.97 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0093  RNP-1 like RNA-binding protein  38.36 
 
 
90 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  38.27 
 
 
245 aa  63.2  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6046  RNP-1 like RNA-binding protein  40.79 
 
 
124 aa  62.8  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35961  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 
90 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0802  RNP-1 like RNA-binding protein  39.02 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209156 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  37.18 
 
 
477 aa  62.4  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1536  RNP-1 like RNA-binding protein  39.74 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.217942 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  39.24 
 
 
88 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>