More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_13151 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_13151  DNA polymerase I  100 
 
 		 976 aa  1974    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12141  DNA polymerase I  60.92 
 
 		 985 aa  1206    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.503839 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08691  DNA polymerase I  59.94 
 
 		 986 aa  1196    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0748  DNA polymerase I  62.63 
 
 		 986 aa  1242    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100174  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0581  DNA polymerase I  48.4 
 
 		 977 aa  862    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0693  DNA polymerase I  58.66 
 
 		 998 aa  1201    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.433628  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1966  DNA polymerase I  59.19 
 
 		 986 aa  1201    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.378529 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1236  DNA polymerase I  95.9 
 
 		 976 aa  1904    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0194  DNA polymerase I  50.05 
 
 		 953 aa  912    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4231  DNA polymerase I  48.02 
 
 		 966 aa  852    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0850  DNA polymerase I  45.42 
 
 		 982 aa  834    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0300789 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3011  DNA polymerase I  48.63 
 
 		 972 aa  868    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13041  DNA polymerase I  85.04 
 
 		 976 aa  1710    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13291  DNA polymerase I  96.11 
 
 		 976 aa  1909    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15881  DNA polymerase I  62.32 
 
 		 986 aa  1236    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.65374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0136  DNA polymerase I  47.62 
 
 		 982 aa  851    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.3801  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3109  DNA polymerase I  48.63 
 
 		 972 aa  868    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  38.05 
 
 		 892 aa  632  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  37.2 
 
 		 891 aa  609  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  38.79 
 
 		 892 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  37.76 
 
 		 892 aa  600  1e-170  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  38.48 
 
 		 951 aa  599  1e-170  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  37.63 
 
 		 916 aa  597  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  38.06 
 
 		 926 aa  597  1e-169  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  37.21 
 
 		 912 aa  597  1e-169  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  38.04 
 
 		 893 aa  595  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  36.87 
 
 		 891 aa  595  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  36.99 
 
 		 903 aa  590  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  36.9 
 
 		 893 aa  589  1e-167  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  36.73 
 
 		 915 aa  590  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  36.07 
 
 		 903 aa  587  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  38.29 
 
 		 944 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  38.85 
 
 		 888 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  37.4 
 
 		 892 aa  581  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  36.49 
 
 		 893 aa  580  1e-164  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  36.32 
 
 		 911 aa  581  1e-164  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  38.04 
 
 		 928 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  37.28 
 
 		 931 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  37.18 
 
 		 950 aa  574  1.0000000000000001e-162  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  37.18 
 
 		 899 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  37.24 
 
 		 928 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  37.18 
 
 		 899 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  37.09 
 
 		 892 aa  575  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  38.22 
 
 		 928 aa  569  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  38.22 
 
 		 928 aa  569  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  38.22 
 
 		 928 aa  569  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  38.22 
 
 		 928 aa  569  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  36.65 
 
 		 906 aa  570  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0163  DNA polymerase A  36.14 
 
 		 906 aa  572  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  36.25 
 
 		 941 aa  570  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4827  DNA polymerase I  36.41 
 
 		 917 aa  572  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00421235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  37.12 
 
 		 930 aa  570  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  38.22 
 
 		 928 aa  569  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  36.42 
 
 		 908 aa  572  1e-161  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  38.22 
 
 		 928 aa  569  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  36.87 
 
 		 934 aa  571  1e-161  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  36.05 
 
 		 939 aa  572  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  38.19 
 
 		 945 aa  569  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  36.14 
 
 		 924 aa  572  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  36.11 
 
 		 942 aa  569  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  38.22 
 
 		 928 aa  569  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1062  DNA polymerase I  34.7 
 
 		 934 aa  568  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  36.04 
 
 		 926 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  36.04 
 
 		 926 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  36.04 
 
 		 926 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  37 
 
 		 896 aa  567  1e-160  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0299  DNA polymerase I  36.32 
 
 		 992 aa  566  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  35.93 
 
 		 923 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  36.61 
 
 		 924 aa  566  1e-160  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  36.04 
 
 		 926 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  37.64 
 
 		 928 aa  566  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3243  DNA polymerase I  36.48 
 
 		 917 aa  568  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0154529 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  35.93 
 
 		 923 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  38.12 
 
 		 928 aa  565  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  36.72 
 
 		 934 aa  564  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  36.4 
 
 		 902 aa  562  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2218  DNA polymerase I  36.21 
 
 		 917 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3769  DNA polymerase I  36.27 
 
 		 917 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.662383  hitchhiker  0.00614094 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  36.23 
 
 		 930 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  37.61 
 
 		 943 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  35.93 
 
 		 923 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6788  DNA polymerase I  36.04 
 
 		 913 aa  561  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0147599  hitchhiker  0.00000170009 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  36.59 
 
 		 896 aa  562  1e-158  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  37.1 
 
 		 929 aa  560  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  36.26 
 
 		 949 aa  560  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  38.1 
 
 		 935 aa  562  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  34.63 
 
 		 939 aa  560  1e-158  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2834  DNA polymerase I  35.92 
 
 		 913 aa  560  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  36.89 
 
 		 933 aa  561  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  36.3 
 
 		 928 aa  560  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  36.73 
 
 		 911 aa  559  1e-158  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  37.52 
 
 		 979 aa  560  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  36.3 
 
 		 902 aa  559  1e-158  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  37.61 
 
 		 936 aa  562  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  36.02 
 
 		 937 aa  558  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2042  DNA polymerase I  36.02 
 
 		 937 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3655  DNA polymerase I  36.21 
 
 		 917 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4493  DNA polymerase I  36.21 
 
 		 917 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  35.54 
 
 		 913 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3872  DNA polymerase I  36.21 
 
 		 917 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>