55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4104 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4104  histidine kinase HAMP region domain protein  100 
 
 		 389 aa  758    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3961  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  93.61 
 
 		 391 aa  657    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.4242  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4071  histidine kinase HAMP region domain protein  95.91 
 
 		 391 aa  656    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.554388  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3465  hypothetical protein  44.47 
 
 		 390 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.485556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3529  hypothetical protein  44.21 
 
 		 390 aa  275  8e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.716011  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3382  hypothetical protein  47.44 
 
 		 390 aa  270  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.304434  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3443  hypothetical protein  43.42 
 
 		 394 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.264114  normal  0.476005 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0878  histidine kinase, HAMP protein  31.7 
 
 		 394 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0834  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.77 
 
 		 622 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0885  hypothetical protein  32.3 
 
 		 363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3761  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.37 
 
 		 822 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0541  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 587 aa  129  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000947824  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 678 aa  130  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 679 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3654  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.66 
 
 		 822 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720146  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.96 
 
 		 1398 aa  126  8.000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2855  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 599 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.73 
 
 		 1397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2754  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 		 1275 aa  111  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.727357 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0072  methyl-accepting chemotaxis protein  24.85 
 
 		 712 aa  91.7  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.56 
 
 		 636 aa  87.4  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.18 
 
 		 634 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.68 
 
 		 653 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0971  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.49 
 
 		 777 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.271758  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  27.93 
 
 		 634 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.25 
 
 		 626 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.670502  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.87 
 
 		 637 aa  69.3  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0539  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.81 
 
 		 633 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.13 
 
 		 633 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.7 
 
 		 638 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0567  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.81 
 
 		 633 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3773  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.49 
 
 		 633 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9088  methyl-accepting chemotaxis protein  26.07 
 
 		 761 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.03 
 
 		 762 aa  65.1  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.463366  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.22 
 
 		 619 aa  63.5  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0042391  normal  0.0195698 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.45 
 
 		 634 aa  60.8  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1358  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.73 
 
 		 723 aa  60.8  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.48099  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.5 
 
 		 637 aa  59.7  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.01 
 
 		 655 aa  57.4  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.4 
 
 		 651 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.39 
 
 		 667 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000234524  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1143  diguanylate cyclase  27.19 
 
 		 532 aa  54.7  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2463  diguanylate cyclase  29.41 
 
 		 637 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.244329  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5094  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.4 
 
 		 659 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.298675 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3442  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.32 
 
 		 646 aa  50.1  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0622548  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0785  diguanylate cyclase  22.5 
 
 		 502 aa  48.5  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1479  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.25 
 
 		 640 aa  47.4  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0522747  normal  0.0374393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0298  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.74 
 
 		 899 aa  47  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0542846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3475  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.75 
 
 		 649 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3197  putative methyl accepting chemotaxis protein  23.53 
 
 		 337 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0703  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.38 
 
 		 805 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2501  hypothetical protein  25 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.257931 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.84 
 
 		 532 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.826751  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2151  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.24 
 
 		 707 aa  43.9  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0660  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.55 
 
 		 675 aa  43.9  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.84238 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>