226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1620 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1620  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  626  1e-178  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1615  hypothetical protein  97.99 
 
 
298 aa  617  1e-176  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4013  Myo-inosose-2 dehydratase  53.29 
 
 
297 aa  323  3e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2299  myo-inositol catabolism protein  51.2 
 
 
298 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2531  putative IolE protein  51.2 
 
 
298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32551e-17 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0303  myo-inositol catabolism protein  51.03 
 
 
298 aa  301  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2255  myo-inositol catabolism protein  50.52 
 
 
298 aa  300  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0086  myo-inositol catabolism protein IolE  50.17 
 
 
297 aa  299  5e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5694  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  46.26 
 
 
300 aa  273  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1577  myo-inositol catabolism protein  46.08 
 
 
298 aa  269  4e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.357804  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4656  xylose isomerase domain-containing protein  45.05 
 
 
298 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4706  inosose dehydratase  42.03 
 
 
301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000727756  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2995  Myo-inosose-2 dehydratase  42.81 
 
 
296 aa  246  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3333  Myo-inosose-2 dehydratase  42.86 
 
 
296 aa  246  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1342  Myo-inosose-2 dehydratase  42.12 
 
 
296 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4190  xylose isomerase-like TIM barrel  43.15 
 
 
371 aa  243  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.720259  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3138  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  44.67 
 
 
359 aa  238  9e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2981  Myo-inosose-2 dehydratase  44.67 
 
 
359 aa  238  9e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.833328 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1869  AP endonuclease  41.89 
 
 
350 aa  236  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3040  xylose isomerase domain-containing protein  41.89 
 
 
368 aa  236  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0043  xylose isomerase domain-containing protein  39.79 
 
 
308 aa  235  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5989  xylose isomerase domain-containing protein  42.19 
 
 
312 aa  235  6e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  0.171061 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2968  AP endonuclease  41.89 
 
 
306 aa  235  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1596  xylose isomerase domain-containing protein  40.89 
 
 
310 aa  234  9e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0078  hypothetical protein  40.21 
 
 
300 aa  223  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2336  hypothetical protein  48.09 
 
 
237 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3839  xylose isomerase domain-containing protein  40.41 
 
 
300 aa  223  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.27 
 
 
924 aa  220  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4017  xylose isomerase domain-containing protein  38.01 
 
 
302 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3285  sugar phosphate isomerase/epimerase, IolE  37.67 
 
 
302 aa  215  7e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3316  xylose isomerase domain-containing protein  38.28 
 
 
309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7800  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  38.52 
 
 
301 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0715  hypothetical protein  39.59 
 
 
300 aa  212  5.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0671  hypothetical protein  39.59 
 
 
300 aa  212  7e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1324  putative myo-inositol catabolism LolE protein  37.67 
 
 
308 aa  211  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4213  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.07 
 
 
340 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1238  putative myo-inositol catabolism protein  37.62 
 
 
309 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.67 
 
 
305 aa  210  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.279544  normal  0.182339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0486  putative myo-inositol catabolism protein  37.33 
 
 
297 aa  210  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1340  xylose isomerase domain-containing protein  37.95 
 
 
309 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1399  xylose isomerase domain-containing protein  37.95 
 
 
309 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1301  xylose isomerase domain-containing protein  37.62 
 
 
309 aa  208  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1894  xylose isomerase domain-containing protein  37.95 
 
 
309 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.21993 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0939  xylose isomerase-like TIM barrel  37.95 
 
 
309 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00907131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1421  xylose isomerase domain-containing protein  37.95 
 
 
309 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0911  hypothetical protein  38.7 
 
 
306 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1442  AP endonuclease  38.7 
 
 
306 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0438  hypothetical protein  38.7 
 
 
306 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1653  AP endonuclease  38.7 
 
 
306 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0724  AP endonuclease  38.7 
 
 
306 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367793  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3560  xylose isomerase domain-containing protein  38.79 
 
 
300 aa  206  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2932  xylose isomerase domain-containing protein  36.6 
 
 
308 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688703 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2649  hypothetical protein  38.36 
 
 
306 aa  205  7e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0432409  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4565  xylose isomerase-like TIM barrel  37.62 
 
 
309 aa  205  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0833957  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1829  hypothetical protein  38.36 
 
 
306 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0766527  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1602  xylose isomerase domain-containing protein  36.82 
 
 
306 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1675  AP endonuclease  38.36 
 
 
306 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173299  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2835  xylose isomerase domain-containing protein  38.64 
 
 
310 aa  203  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840707  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0067  xylose isomerase domain-containing protein  37.95 
 
 
318 aa  201  9e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0290166  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2325  xylose isomerase domain-containing protein  38.49 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.01 
 
 
294 aa  189  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3499  iolE protein  35.62 
 
 
301 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3273  AP endonuclease  35.96 
 
 
301 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0853475  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50050  2-keto-myo-inositol dehydratase  33.9 
 
 
303 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1674  xylose isomerase domain-containing protein  36.04 
 
 
298 aa  185  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1133  Myo-inosose-2 dehydratase  35.92 
 
 
305 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459716  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.6 
 
 
305 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2054  xylose isomerase domain-containing protein  30.62 
 
 
308 aa  136  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1247  putative myo-inositol catabolism protein  28.81 
 
 
313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2746  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.7 
 
 
330 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1696  Myo-inosose-2 dehydratase  27.63 
 
 
308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1048  Myo-inosose-2 dehydratase  29.03 
 
 
307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.513171  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0657  Myo-inosose-2 dehydratase  30.3 
 
 
303 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4055  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.61 
 
 
297 aa  123  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1348  xylose isomerase domain-containing protein  29.35 
 
 
308 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0824  xylose isomerase domain-containing protein  30.95 
 
 
303 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1309  xylose isomerase domain-containing protein  29.01 
 
 
308 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50250  hypothetical protein  28.14 
 
 
307 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0941  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.27 
 
 
303 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3346  xylose isomerase-like TIM barrel  28.67 
 
 
297 aa  119  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0217845  normal  0.180586 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1886  xylose isomerase domain-containing protein  28.81 
 
 
308 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206917 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4573  xylose isomerase-like TIM barrel  28.14 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0386  xylose isomerase domain-containing protein  29.22 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0947  xylose isomerase-like TIM barrel  27.8 
 
 
308 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1429  xylose isomerase domain-containing protein  27.8 
 
 
308 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7455  hypothetical protein  25.61 
 
 
292 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0730  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.9 
 
 
295 aa  113  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200556  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1407  xylose isomerase domain-containing protein  27.46 
 
 
308 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3018  hypothetical protein  28.34 
 
 
307 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.130345  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1816  xylose isomerase domain-containing protein  25.68 
 
 
304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.670883 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1981  Myo-inosose-2 dehydratase  28.24 
 
 
301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.162742  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1271  xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.14 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2490  xylose isomerase domain-containing protein  29.29 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  normal  0.973607 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3352  Myo-inosose-2 dehydratase  25.94 
 
 
296 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0467219  normal  0.0568196 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1422  xylose isomerase-like  26.67 
 
 
297 aa  105  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0452084  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2612  xylose isomerase domain-containing protein  26.84 
 
 
294 aa  102  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1362  Myo-inosose-2 dehydratase  26.69 
 
 
294 aa  102  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4487  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.52 
 
 
289 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411638  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.93 
 
 
284 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3969  xylose isomerase domain-containing protein  25.42 
 
 
290 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0171269  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>