22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0176 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0176  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  499  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0158  hypothetical protein  95.8 
 
 		 238 aa  483  1e-135  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9815  Type IV secretory pathway component VirB8  26.81 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6400  VirB8 family protein  26.89 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4440  VirB8  26.11 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4173  VirB8  25.64 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717202  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4558  VirB8 family protein  31.51 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5004  VirB8 family protein  25.56 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04145  normal  0.518843 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5819  VirB8 family protein  23.61 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0682  VirB8 family protein  25 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765146  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6330  VirB8 family protein  25.22 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0251  Type IV secretory pathway AvhB8 protein  24.78 
 
 		 223 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4341  VirB8  24.68 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342732  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5081  VirB8 family protein  25.32 
 
 		 223 aa  45.8  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5023  VirB8 family protein  37.31 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00032583  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6211  VirB8 family protein  21.53 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0724347 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0022  VirB8  23.85 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0044  type IV secretion system protein VirB8  23.39 
 
 		 237 aa  43.1  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.677049  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3318  VirB8 family protein  25.37 
 
 		 234 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4848  VirB8  25.37 
 
 		 234 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6500  VirB8 family protein  20.89 
 
 		 234 aa  42.4  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4372  VirB8 family protein  34.25 
 
 		 228 aa  42  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.929771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>