More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0981 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl0981  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  598  1e-170  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1014  hypothetical protein  97.26 
 
 
292 aa  588  1e-167  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  47.96 
 
 
300 aa  269  4e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  48.25 
 
 
310 aa  258  7e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  44.92 
 
 
322 aa  257  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  45.36 
 
 
323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  44.88 
 
 
305 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  42.81 
 
 
335 aa  247  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1887  hypothetical protein  43.05 
 
 
301 aa  245  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.261271  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1881  hypothetical protein  43.05 
 
 
301 aa  245  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.256375  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1944  hypothetical protein  43.05 
 
 
301 aa  245  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1391  hypothetical protein  43.05 
 
 
301 aa  245  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.4061  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1574  hypothetical protein  43.05 
 
 
301 aa  245  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1673  Patatin  43.17 
 
 
316 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  42.67 
 
 
348 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  41.97 
 
 
323 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2082  patatin  42.86 
 
 
316 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00726346  normal  0.98017 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01210  hypothetical protein  42.09 
 
 
314 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.287845  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2415  Patatin  42.09 
 
 
314 aa  241  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1399  hypothetical protein  42.09 
 
 
301 aa  241  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1342  hypothetical protein  42.09 
 
 
301 aa  241  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00416031  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2393  hypothetical protein  42.09 
 
 
314 aa  241  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000191972 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01220  hypothetical protein  42.09 
 
 
314 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.237609  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  41.95 
 
 
300 aa  240  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2279  hypothetical protein  41.61 
 
 
303 aa  240  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1719  hypothetical protein  41.75 
 
 
314 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00963629  normal  0.824632 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1907  hypothetical protein  41.75 
 
 
314 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163252  normal  0.264575 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1383  hypothetical protein  41.75 
 
 
301 aa  238  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.117761  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  41.37 
 
 
347 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  43.29 
 
 
335 aa  235  7e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2309  hypothetical protein  42.81 
 
 
300 aa  233  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3119  Patatin  45.03 
 
 
324 aa  232  5e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  41.36 
 
 
304 aa  232  6e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1418  patatin  41.53 
 
 
333 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.84629  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1978  hypothetical protein  38.67 
 
 
301 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2711  hypothetical protein  40.67 
 
 
301 aa  231  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  hitchhiker  0.000234517 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  40.92 
 
 
345 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0681  patatin-like phospholipase family protein  43.96 
 
 
299 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  41.64 
 
 
343 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  39.87 
 
 
390 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0830  Patatin  43.96 
 
 
299 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00263851  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3892  Patatin  39.94 
 
 
343 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  41.02 
 
 
315 aa  225  8e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  41.87 
 
 
314 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  40.68 
 
 
315 aa  224  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  41.37 
 
 
354 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1274  hypothetical protein  39.53 
 
 
311 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  43.57 
 
 
326 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02066  Alpha-beta superfamily hydrolase  38.3 
 
 
341 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2928  putative patatin-like phospholipase  41.33 
 
 
317 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793052  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1851  Patatin  41.91 
 
 
320 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202121  normal  0.0299677 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0353  Patatin  40.72 
 
 
321 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.016762 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2051  Patatin  41.91 
 
 
320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1553  Patatin  40.47 
 
 
317 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2444  patatin  38.31 
 
 
312 aa  211  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2697  Patatin  41.02 
 
 
315 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00646422  hitchhiker  0.0000697088 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1683  patatin  41.02 
 
 
315 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234772  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1646  patatin  41.02 
 
 
315 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1661  patatin  41.02 
 
 
315 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  41.03 
 
 
315 aa  210  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3127  patatin  41.45 
 
 
344 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238367  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1047  patatin  43.54 
 
 
321 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  41.58 
 
 
327 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3230  patatin  38.91 
 
 
352 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000670188  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1793  patatin  37.5 
 
 
343 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.810977 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  37.58 
 
 
323 aa  203  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  39.18 
 
 
323 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1647  patatin  41.94 
 
 
373 aa  201  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3052  patatin  40.07 
 
 
311 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.443611  normal  0.0107165 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  53.89 
 
 
327 aa  199  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2623  patatin  40.4 
 
 
328 aa  199  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0385483  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2263  patatin  36.25 
 
 
352 aa  199  6e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.622551  normal  0.202768 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2605  patatin  39.93 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2220  Patatin  36.45 
 
 
351 aa  196  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0960823 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2451  patatin  39.02 
 
 
343 aa  196  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2836  hypothetical protein  39.22 
 
 
315 aa  194  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2443  patatin  39.22 
 
 
315 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000356769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2513  patatin  38.95 
 
 
315 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000191978 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2538  Patatin  35.94 
 
 
352 aa  193  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.54485 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2204  hypothetical protein  42.75 
 
 
316 aa  192  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1538  patatin  38.57 
 
 
320 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.546797  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1595  patatin  39.54 
 
 
310 aa  186  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.613745  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1593  Patatin  39.58 
 
 
340 aa  185  7e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2826  patatin-like phospholipase family protein  36.46 
 
 
295 aa  182  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.801002  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2662  patatin  49.44 
 
 
368 aa  180  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31003  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2071  Patatin  35.29 
 
 
325 aa  175  8e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.157936  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1747  patatin  42.18 
 
 
346 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000400605 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0190  Patatin  32.45 
 
 
314 aa  170  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10170  FabD/lysophospholipase-like protein  33.55 
 
 
329 aa  170  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.280701  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3633  hypothetical protein  41.71 
 
 
345 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43300  hypothetical protein  41.71 
 
 
345 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.882188  normal  0.835077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2305  patatin  41.23 
 
 
348 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00029553 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3464  patatin  41.23 
 
 
346 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102358 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4027  patatin  42.31 
 
 
345 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.353324  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1907  patatin  40.76 
 
 
346 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331125  hitchhiker  0.00000758802 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1481  Patatin  31.14 
 
 
339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.018305  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11081  hypothetical protein  32.1 
 
 
360 aa  166  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000132492  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2456  patatin  41.71 
 
 
336 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  35.53 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2469  patatin  33.44 
 
 
347 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.504238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>