More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2782 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012892  B21_03947  hypothetical protein  87.07 
 
 
445 aa  780  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2861  arginine:agmatin antiporter  100 
 
 
444 aa  880  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0608832  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4640  arginine:agmatin antiporter  87.53 
 
 
445 aa  782  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4612  arginine:agmatin antiporter  86.85 
 
 
445 aa  776  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2782  arginine:agmatin antiporter  100 
 
 
444 aa  880  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.604082  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3912  arginine:agmatin antiporter  87.07 
 
 
445 aa  780  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27107  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4669  arginine:agmatin antiporter  87.07 
 
 
445 aa  780  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1326  arginine:agmatin antiporter  99.77 
 
 
444 aa  879  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.501085  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4580  arginine:agmatin antiporter  87.07 
 
 
445 aa  780  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4640  arginine:agmatin antiporter  87.53 
 
 
445 aa  782  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4355  arginine:agmatin antiporter  86.85 
 
 
445 aa  778  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.705479  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03986  arginine:agmatin  87.07 
 
 
445 aa  780  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3877  amino acid permease-associated region  87.07 
 
 
445 aa  780  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  87.53 
 
 
445 aa  782  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4549  arginine:agmatin antiporter  87.3 
 
 
445 aa  779  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5628  arginine:agmatin antiporter  87.07 
 
 
445 aa  780  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  87.53 
 
 
445 aa  782  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3702  arginine:agmatin antiporter  55.3 
 
 
509 aa  497  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4344  arginine:agmatin antiporter  54.84 
 
 
508 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.620829  hitchhiker  0.000578907 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4860  arginine:agmatin antiporter  55.3 
 
 
508 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086172  hitchhiker  0.00303215 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0780  arginine:agmatin antiporter  54.84 
 
 
510 aa  494  1e-138  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.0754473 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2394  arginine:agmatin antiporter  50.83 
 
 
450 aa  417  1e-115  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.66662  normal  0.401461 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2800  lysine/cadaverine antiporter  39.81 
 
 
443 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.1623  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2759  lysine/cadaverine antiporter  39.81 
 
 
443 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420004  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2934  lysine/cadaverine antiporter  39.81 
 
 
443 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.252343  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2717  lysine/cadaverine antiporter  39.81 
 
 
443 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2821  lysine/cadaverine antiporter  39.81 
 
 
443 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3768  lysine/cadaverine antiporter  39.69 
 
 
449 aa  310  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  5.19797e-05  normal  0.028767 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002188  lysine/cadaverine antiporter membrane protein CadB  38.53 
 
 
447 aa  302  8e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000189693  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00206  lysine/cadaverine antiporter  37.56 
 
 
448 aa  295  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2492  lysine/cadaverine antiporter  38.52 
 
 
444 aa  291  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2657  lysine/cadaverine antiporter  37.78 
 
 
445 aa  291  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3895  lysine/cadaverine antiporter  38.44 
 
 
444 aa  289  7e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4373  lysine/cadaverine antiporter  38.44 
 
 
444 aa  289  7e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0915774  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1006  lysine/cadaverine antiporter  38.35 
 
 
438 aa  289  7e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  7.05878e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5648  lysine/cadaverine antiporter  38.44 
 
 
444 aa  289  7e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.742778  normal  0.745814 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4601  lysine/cadaverine antiporter  38.44 
 
 
444 aa  289  7e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000619747  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4687  lysine/cadaverine antiporter  38.44 
 
 
444 aa  289  7e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04003  predicted lysine/cadaverine transporter  38.44 
 
 
444 aa  289  7e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03965  hypothetical protein  38.44 
 
 
444 aa  289  7e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6446  amino acid permease-associated region  36.21 
 
 
750 aa  285  9e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.396159 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3254  putrescine transporter  37.12 
 
 
442 aa  283  5e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5194  putrescine transporter  35.04 
 
 
452 aa  279  6e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  36.84 
 
 
451 aa  272  9e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0180  putrescine transporter  36.41 
 
 
439 aa  272  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  37.67 
 
 
451 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4085  putrescine transporter  35.77 
 
 
439 aa  270  3e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3976  putrescine transporter  35.77 
 
 
439 aa  270  3e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4172  putrescine transporter  35.77 
 
 
439 aa  270  3e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4054  putrescine transporter  35.77 
 
 
439 aa  270  3e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0508  putrescine transporter  35.92 
 
 
440 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3680  putrescine transporter  35.28 
 
 
439 aa  267  3e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3335  putrescine transporter  35.58 
 
 
438 aa  266  5e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0313  putrescine transporter  35.19 
 
 
439 aa  266  8e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3668  putrescine transporter  35.44 
 
 
439 aa  264  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0277  putrescine transporter  35.68 
 
 
439 aa  263  4e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1574  putrescine transporter  34.43 
 
 
436 aa  263  5e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3872  putrescine transporter  35.19 
 
 
439 aa  262  8e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0414158 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2989  putrescine transporter  34.32 
 
 
443 aa  262  9e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00443871  normal  0.0573626 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04834  putrescine transporter  34.61 
 
 
436 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001093  putrescine/proton symporter putrescine/ornithine antiporter PotE  34.37 
 
 
436 aa  259  5e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1067  putrescine transporter  34.29 
 
 
439 aa  259  1e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0760  putrescine transporter  34.05 
 
 
439 aa  254  2e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.428261  normal  0.419082 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0808  putrescine transporter  34.05 
 
 
439 aa  254  2e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.210181  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0857  putrescine transporter  34.05 
 
 
439 aa  254  2e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0747  putrescine transporter  34.05 
 
 
439 aa  254  2e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110662  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0821  putrescine transporter  34.05 
 
 
439 aa  254  2e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.438039  normal  0.147845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2445  putrescine transporter  34.72 
 
 
446 aa  253  4e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273787  normal  0.196088 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4011  putrescine transporter  34.62 
 
 
461 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.253932  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4355  putrescine transporter  34.62 
 
 
461 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879219  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0714  putrescine transporter  34.13 
 
 
439 aa  250  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0136028  normal  0.578449 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1204  putrescine transporter  33.33 
 
 
437 aa  248  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.658764  decreased coverage  3.77329e-05 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3513  putrescine transporter  34.46 
 
 
461 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.015578 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2964  putrescine transporter  33.57 
 
 
439 aa  245  1e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.018093  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00640  hypothetical protein  33.57 
 
 
439 aa  245  1e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.167643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2945  arginine/ornithine antiporter  33.57 
 
 
439 aa  245  1e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00648  putrescine/proton symporter: putrescine/ornithine antiporter  33.57 
 
 
439 aa  245  1e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.173719  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0717  putrescine transporter  33.33 
 
 
439 aa  244  2e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.93165e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0784  putrescine transporter  33.57 
 
 
439 aa  244  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0285849  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  33.25 
 
 
445 aa  240  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4244  amino acid permease-associated region  36.05 
 
 
453 aa  219  7e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.399011  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  34.15 
 
 
460 aa  213  7e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2801  amino acid permease  33.49 
 
 
476 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764757  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5198  amino acid permease-associated region  31.86 
 
 
441 aa  207  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  32.42 
 
 
440 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3167  amino acid permease-associated region  32.75 
 
 
436 aa  187  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0536  amino acid permease-associated region  30.99 
 
 
435 aa  184  2e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.555012  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0957  amino acid permease family protein  30.24 
 
 
411 aa  182  1e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.253131  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2206  amino acid permease-associated region  28.41 
 
 
452 aa  179  7e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218547  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  29.47 
 
 
447 aa  177  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4672  amino acid permease family protein  31.31 
 
 
465 aa  176  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  4.1139e-21 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1458  arginine/ornithine antiporter  31.35 
 
 
472 aa  176  6e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0071658  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0697  amino acid permease family protein  31.08 
 
 
465 aa  176  1e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0665  amino acid permease family protein  31.76 
 
 
465 aa  175  1e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0596  amino acid permease family protein  30.86 
 
 
465 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0684  amino acid permease family protein  30.86 
 
 
465 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0540  arginine/ornithine antiporter protein  30.86 
 
 
465 aa  170  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0542  amino acid permease-associated region  31.31 
 
 
465 aa  170  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0758  amino acid permease family protein  30.63 
 
 
465 aa  170  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0629  amino acid permease family protein  30.63 
 
 
465 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>