More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0080 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4034  two-component sensor protein  82.16 
 
 
456 aa  713  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5366  two-component sensor protein  80.84 
 
 
457 aa  710  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.135229  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4304  two-component sensor protein  80.84 
 
 
457 aa  710  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335985  hitchhiker  0.00831139 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03746  hypothetical protein  80.62 
 
 
457 aa  707  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.228988  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4391  two-component sensor protein  81.06 
 
 
457 aa  711  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3851  two-component sensor protein  83.04 
 
 
456 aa  712  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257653  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4345  two-component sensor protein  80.62 
 
 
457 aa  705  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.60495e-07 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4389  two-component sensor protein  80.62 
 
 
457 aa  705  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4275  two-component sensor protein  80.62 
 
 
457 aa  705  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0080  two-component sensor protein  100 
 
 
458 aa  934  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4304  two-component sensor protein  80.62 
 
 
457 aa  705  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4456  two-component sensor protein  80.62 
 
 
457 aa  706  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.874205  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4106  two-component sensor protein  80.84 
 
 
457 aa  710  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0135  two-component sensor protein  82.16 
 
 
456 aa  703  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0083  two-component sensor protein  100 
 
 
458 aa  934  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4073  histidine kinase  80.84 
 
 
457 aa  710  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03797  two-component sensor protein  80.62 
 
 
457 aa  707  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197394  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4142  two-component sensor protein  80.84 
 
 
457 aa  710  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4445  two-component sensor protein  80.84 
 
 
457 aa  710  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4061  two-component sensor protein  80.62 
 
 
457 aa  686  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000114618  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4811  two-component sensor protein  87.69 
 
 
457 aa  771  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4133  two-component sensor protein  100 
 
 
458 aa  934  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000603711  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0127  two-component sensor protein  81.72 
 
 
456 aa  699  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.581229  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  43.64 
 
 
462 aa  366  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00150  two-component sensor protein  44.42 
 
 
468 aa  342  1e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2265  two-component sensor protein  45.59 
 
 
464 aa  335  8e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.6955e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002218  copper sensory histidine kinase CpxA  43.54 
 
 
464 aa  335  8e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00500804  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1563  two-component sensor protein  43.94 
 
 
462 aa  333  4e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0211218  unclonable  3.59419e-12 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 
458 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  36.04 
 
 
458 aa  245  1e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  1.37847e-05 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 
454 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 
449 aa  243  6e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 
449 aa  243  7e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
458 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  36.26 
 
 
453 aa  241  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 
466 aa  240  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  35.38 
 
 
449 aa  237  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  2.6524e-09 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  34.33 
 
 
458 aa  233  5e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  36.26 
 
 
449 aa  232  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 
455 aa  229  9e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  4.04182e-09 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
459 aa  225  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  5.34801e-06  unclonable  3.36351e-08 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  38.56 
 
 
471 aa  224  4e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 
455 aa  221  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 
449 aa  214  2e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.59 
 
 
389 aa  197  4e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  37 
 
 
459 aa  189  8e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  4.58656e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  28.76 
 
 
472 aa  188  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 
467 aa  188  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  34.91 
 
 
453 aa  178  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  36.36 
 
 
452 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  29.74 
 
 
455 aa  169  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  29.53 
 
 
455 aa  167  3e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1333  histidine kinase  33.33 
 
 
461 aa  166  7e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249082  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0870  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
469 aa  166  1e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
461 aa  165  2e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  38.38 
 
 
412 aa  163  5e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4493  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 
458 aa  156  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130131  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
442 aa  156  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2278  sensor histidine kinase  32.98 
 
 
465 aa  155  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  36.46 
 
 
465 aa  154  3e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
469 aa  154  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  34.14 
 
 
429 aa  152  9e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 
419 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335551  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 
420 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235334  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 
445 aa  152  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3063  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.12 
 
 
433 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9979  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
429 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  34.68 
 
 
381 aa  152  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
456 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
456 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.403806  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  36.88 
 
 
480 aa  150  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1740  sensor histidine kinase  34.57 
 
 
442 aa  150  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187783  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 
421 aa  149  1e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
454 aa  149  1e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0937  sensor histidine kinase  29.18 
 
 
440 aa  148  2e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.47175e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1518  sensor histidine kinase  34.08 
 
 
442 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250734  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1145  sensor histidine kinase  34.08 
 
 
442 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0095  sensor histidine kinase  34.08 
 
 
442 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  35.19 
 
 
416 aa  148  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 
449 aa  147  4e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  36.33 
 
 
449 aa  146  7e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1018  sensor histidine kinase  33.71 
 
 
442 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2034  histidine kinase  33.85 
 
 
433 aa  145  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0105815  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 
455 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2258  sensor kinase protein  33.71 
 
 
442 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0933  sensor histidine kinase  33.71 
 
 
442 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1590  sensor protein RstB  33.85 
 
 
433 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00520331  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1789  sensor protein RstB  30.17 
 
 
451 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1753  sensor protein RstB  30.82 
 
 
435 aa  146  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.280951  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1795  sensor protein RstB  33.85 
 
 
433 aa  145  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0023579  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1817  sensor protein RstB  33.85 
 
 
433 aa  145  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0672231  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 
457 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  35.97 
 
 
449 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.10804e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2319  sensor protein RstB  33.85 
 
 
433 aa  145  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0220654  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2512  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
453 aa  144  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  34.3 
 
 
456 aa  143  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2324  histidine kinase  31.25 
 
 
561 aa  143  5e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00982982  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 
479 aa  144  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
563 aa  143  6e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571647  normal  0.0293056 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
440 aa  143  8e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>