47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0028 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0028  hypothetical protein  100 
 
 
420 aa  834  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1797  putative exported protein of unknown function  56.64 
 
 
427 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227031  normal  0.544981 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1846  hypothetical protein  56.06 
 
 
429 aa  467  1e-130  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2181  hypothetical protein  55.82 
 
 
422 aa  464  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5317  hypothetical protein  61.13 
 
 
424 aa  454  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0865725  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5013  hypothetical protein  60.86 
 
 
423 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333808  normal  0.0166676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2721  hypothetical protein  57.45 
 
 
423 aa  428  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5945  hypothetical protein  46.36 
 
 
400 aa  355  8e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0007  hypothetical protein  47.85 
 
 
410 aa  337  2e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1537  hypothetical protein  48.79 
 
 
408 aa  332  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.505562  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2412  hypothetical protein  49.17 
 
 
411 aa  332  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1278  hypothetical protein  47.8 
 
 
367 aa  329  6e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1336  hypothetical protein  47.98 
 
 
408 aa  327  2e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.616275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4870  hypothetical protein  48.25 
 
 
408 aa  325  9e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.128964 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2664  hypothetical protein  48.1 
 
 
386 aa  317  3e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164078  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3621  hypothetical protein  49.44 
 
 
402 aa  315  8e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3938  hypothetical protein  44.79 
 
 
429 aa  307  2e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350729  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1948  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  43.09 
 
 
391 aa  302  6e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105929  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1941  hypothetical protein  44.62 
 
 
393 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1240  hypothetical protein  42.93 
 
 
394 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.314539  normal  0.831655 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0026  hypothetical protein  43.42 
 
 
395 aa  289  6e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3093  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  42.08 
 
 
397 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239597  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2582  hypothetical protein  44.38 
 
 
369 aa  286  3e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3133  hypothetical protein  41.73 
 
 
392 aa  283  5e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.637765 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3146  hypothetical protein  40 
 
 
412 aa  280  3e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0483  hypothetical protein  41.67 
 
 
395 aa  275  1e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1891  hypothetical protein  37.53 
 
 
408 aa  263  5e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.999876  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2258  hypothetical protein  38.5 
 
 
400 aa  262  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2612  hypothetical protein  37.13 
 
 
416 aa  242  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0743279  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1858  hypothetical protein  37.37 
 
 
405 aa  240  4e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2846  hypothetical protein  39.1 
 
 
394 aa  226  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.194777  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0722  hypothetical protein  40.39 
 
 
402 aa  207  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.126756 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3037  hypothetical protein  38.44 
 
 
393 aa  198  2e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4978  hypothetical protein  37.32 
 
 
406 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638405  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1795  hypothetical protein  37.92 
 
 
391 aa  188  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75604e-06 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  26.09 
 
 
432 aa  78.2  3e-13  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  24.02 
 
 
445 aa  71.2  3e-11  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5857  extracellular ligand-binding receptor  24.68 
 
 
411 aa  67.8  4e-10  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101493  normal  0.03083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  24.66 
 
 
415 aa  63.5  7e-09  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  22.85 
 
 
419 aa  62.4  1e-08  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  24.1 
 
 
415 aa  58.5  2e-07  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3574  hypothetical protein  23.66 
 
 
413 aa  55.8  1e-06  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  23.35 
 
 
396 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05343  hypothetical protein  23.35 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1054  amino acid-binding protein, putative  27 
 
 
426 aa  47.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000719773  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3901  inner-membrane translocator  24.84 
 
 
413 aa  46.6  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3517  putative transporter signal peptide protein  22.65 
 
 
426 aa  43.1  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>