74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1182 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1182  hypothetical protein  100 
 
 
671 aa  1359  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0023926  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3853  hypothetical protein  73.3 
 
 
662 aa  979  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  9.36749e-05  normal  0.0170599 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2202  DNA mismatch repair ATPase-like protein  80.34 
 
 
651 aa  1062  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000849326  normal  0.525867 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0684  hypothetical protein  36.08 
 
 
673 aa  353  6e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.093919  hitchhiker  9.85329e-13 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0529  hypothetical protein  38.92 
 
 
609 aa  248  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.320462  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1643  hypothetical protein  27.12 
 
 
361 aa  119  2e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4308  hypothetical protein  23.92 
 
 
702 aa  79  3e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0554257  normal  0.0504363 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1589  hypothetical protein  30.39 
 
 
698 aa  75.5  3e-12  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242692  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4048  histidine kinase  30.77 
 
 
773 aa  66.2  2e-09  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2441  histidine kinase  23.29 
 
 
674 aa  63.2  1e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.459087  unclonable  1.06284e-09 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4222  hypothetical protein  23.76 
 
 
640 aa  62  3e-08  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1062  hypothetical protein  23.88 
 
 
644 aa  60.8  8e-08  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.183826  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0268  histidine kinase  27.22 
 
 
738 aa  60.5  1e-07  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0961  hypothetical protein  25.71 
 
 
587 aa  60.5  1e-07  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.598783  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2516  putative prophage encoded two-component system histidine kinase  31.86 
 
 
774 aa  58.9  3e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222494  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1243  hypothetical protein  32 
 
 
240 aa  58.2  5e-07  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.96031e-06  hitchhiker  1.36742e-10 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3949  histidine kinase  24.64 
 
 
679 aa  57.4  8e-07  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3783  histidine kinase  26.12 
 
 
946 aa  56.2  2e-06  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377863  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00320  hypothetical protein  29.36 
 
 
584 aa  56.2  2e-06  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3436  hypothetical protein  25.87 
 
 
667 aa  54.7  5e-06  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1489  histidine kinase  31.75 
 
 
774 aa  54.3  7e-06  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3988  hypothetical protein  28.1 
 
 
682 aa  52.8  2e-05  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.544109  hitchhiker  0.00814406 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0301  histidine kinase  31.13 
 
 
994 aa  53.1  2e-05  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2655  histidine kinase  29.63 
 
 
771 aa  53.1  2e-05  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0835586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2091  hypothetical protein  26.17 
 
 
642 aa  52  3e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3087  heat shock protein 90  32.54 
 
 
606 aa  50.4  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0079  histidine kinase  24.24 
 
 
987 aa  49.7  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217254  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0504  signal transduction protein, histidine kinase  28 
 
 
997 aa  49.7  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.284164  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4625  histidine kinase  26.52 
 
 
756 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.402141 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1592  heat shock protein 90  30.41 
 
 
633 aa  48.9  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2007  heat shock protein 90  31.13 
 
 
652 aa  48.5  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23829  Heat Shock Protein 90  31.94 
 
 
711 aa  48.1  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07530  chaperone protein HtpG  27.82 
 
 
633 aa  47.8  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.583875  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0749  histidine kinase  31.58 
 
 
722 aa  47.8  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0371  histidine kinase  31.25 
 
 
989 aa  47.8  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_69965  Heat shock protein 90 homolog  28.38 
 
 
709 aa  47.4  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0615348  normal  0.460781 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3161  heat shock protein 90  28.77 
 
 
625 aa  47.4  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0144125 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4127  heat shock protein 90  23.26 
 
 
669 aa  47.4  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745159  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0019  heat shock protein 90  27.94 
 
 
631 aa  47  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0953  heat shock protein 90  31.61 
 
 
624 aa  47  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298384  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3155  DNA mismatch repair protein  30.17 
 
 
566 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51649  DNA mismatch repair  24.54 
 
 
634 aa  47  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0197688  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2208  heat shock protein HtpG  27.27 
 
 
635 aa  47  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0695  HSP90 family protein  31.06 
 
 
643 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1813  heat shock protein 90  25.4 
 
 
638 aa  46.2  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.138988  normal  0.331097 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4053  hypothetical protein  31.96 
 
 
364 aa  46.6  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1719  heat shock protein 90  26.9 
 
 
656 aa  46.6  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2017  heat shock protein 90  27.81 
 
 
637 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1625  heat shock protein 90  27.78 
 
 
634 aa  45.8  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3901  heat shock protein 90  29.77 
 
 
653 aa  45.8  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.795746  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0051  heat shock protein 90  26.98 
 
 
629 aa  45.4  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.544882  normal  0.404377 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0452  heat shock protein 90  31.34 
 
 
629 aa  45.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2506  heat shock protein 90  30.07 
 
 
633 aa  45.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595688  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1548  heat shock protein 90  29.45 
 
 
630 aa  45.4  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00180815  normal  0.134338 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4272  heat shock protein 90  24.69 
 
 
643 aa  45.4  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0141  heat shock protein 90  23.81 
 
 
658 aa  45.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0358231  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0856  heat shock protein 90  24.03 
 
 
627 aa  45.4  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.585619 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5351  heat shock protein 90  27.08 
 
 
630 aa  44.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.514382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1158  hypothetical protein  30.77 
 
 
971 aa  45.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0746072  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0570  ATPase domain-containing protein  30.21 
 
 
720 aa  45.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208854  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0826  heat shock protein 90  24.68 
 
 
657 aa  45.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.257658 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1997  heat shock protein 90  29.33 
 
 
619 aa  44.3  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0958  heat shock protein 90  25.29 
 
 
617 aa  44.3  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36080  ATP binding/ATPase (HATPase_c) domain-containing protein  28.7 
 
 
723 aa  44.3  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.785122  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1372  heat shock protein 90  29.33 
 
 
647 aa  44.3  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145654  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1575  histidine kinase  30 
 
 
684 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  4.14678e-05  decreased coverage  7.4807e-06 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2113  heat shock protein 90  29.37 
 
 
630 aa  44.3  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_19857  Heat Shock Protein 90, endoplasmic reticulum  28.77 
 
 
794 aa  44.3  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.768315  normal 
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_55230  predicted protein  27.27 
 
 
709 aa  44.3  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2743  heat shock protein Hsp90  27.27 
 
 
677 aa  44.3  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0044  heat shock protein 90  33.87 
 
 
611 aa  43.9  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2614  heat shock protein 90  26.61 
 
 
665 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3489  heat shock protein 90  26.61 
 
 
665 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.179421 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2812  heat shock protein 90  28.57 
 
 
637 aa  43.9  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>