More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_51649 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_51649  DNA mismatch repair  100 
 
 		 634 aa  1296    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0197688  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  25.3 
 
 		 611 aa  144  6e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  25.29 
 
 		 655 aa  133  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  24.02 
 
 		 623 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  23.6 
 
 		 635 aa  128  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  25.55 
 
 		 560 aa  128  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  23.25 
 
 		 603 aa  128  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  24.85 
 
 		 559 aa  127  5e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04365  DNA mismatch repair protein (Mlh3), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06490)  33.95 
 
 		 870 aa  124  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.37518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  23.55 
 
 		 572 aa  124  6e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  24.65 
 
 		 630 aa  120  6e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  24.32 
 
 		 611 aa  120  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  23.41 
 
 		 621 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  24.7 
 
 		 629 aa  120  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  24.28 
 
 		 625 aa  118  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4172  DNA mismatch repair protein  30.84 
 
 		 614 aa  117  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  23.64 
 
 		 619 aa  117  6e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1521  DNA mismatch repair protein MutL  24.38 
 
 		 540 aa  117  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  23.57 
 
 		 565 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  23.01 
 
 		 624 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  24.11 
 
 		 619 aa  115  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  29.41 
 
 		 633 aa  114  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  24.57 
 
 		 582 aa  114  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  29.45 
 
 		 641 aa  114  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  29.08 
 
 		 633 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  23.93 
 
 		 574 aa  112  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  23.93 
 
 		 575 aa  112  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  23.55 
 
 		 595 aa  112  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  23.55 
 
 		 595 aa  112  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  23.72 
 
 		 644 aa  112  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3542  DNA mismatch repair protein  29.64 
 
 		 628 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  23.56 
 
 		 660 aa  110  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  23.43 
 
 		 602 aa  110  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  24.66 
 
 		 606 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0433  DNA mismatch repair protein MutL  21.63 
 
 		 544 aa  110  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.397658  normal  0.543427 
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  23.75 
 
 		 566 aa  109  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  29.13 
 
 		 633 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  23.47 
 
 		 566 aa  108  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  24.81 
 
 		 621 aa  108  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  28.25 
 
 		 633 aa  108  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0819  ATPase domain-containing protein  29.94 
 
 		 650 aa  108  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0795  DNA mismatch repair protein  29.97 
 
 		 624 aa  107  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.741444  hitchhiker  0.00456525 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  22.98 
 
 		 648 aa  107  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  28.25 
 
 		 632 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  23.12 
 
 		 632 aa  107  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0564  DNA mismatch repair protein  28.99 
 
 		 631 aa  106  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.273606 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  27.92 
 
 		 645 aa  106  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  24.89 
 
 		 610 aa  106  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  23.2 
 
 		 595 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  27.69 
 
 		 648 aa  106  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  23.09 
 
 		 597 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  27.72 
 
 		 635 aa  106  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  28.25 
 
 		 632 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  24.09 
 
 		 605 aa  105  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  24.63 
 
 		 620 aa  104  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3155  DNA mismatch repair protein  33.33 
 
 		 566 aa  104  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1495  ATP-binding region, ATPase-like  34.41 
 
 		 580 aa  103  7e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  23.2 
 
 		 589 aa  103  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  22.04 
 
 		 617 aa  103  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  27.51 
 
 		 611 aa  103  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  27.39 
 
 		 647 aa  103  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  23.57 
 
 		 600 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0919  DNA mismatch repair protein MutL  32.4 
 
 		 583 aa  102  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  28.15 
 
 		 641 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1964  DNA mismatch repair protein  34.07 
 
 		 561 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1937  DNA mismatch repair protein  34.07 
 
 		 561 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  28.77 
 
 		 647 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  22.53 
 
 		 626 aa  102  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  22.21 
 
 		 647 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3895  DNA mismatch repair protein  29.33 
 
 		 638 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.329435  normal  0.756046 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04630  DNA binding protein, putative  29.18 
 
 		 765 aa  101  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  23.44 
 
 		 600 aa  101  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  27.72 
 
 		 636 aa  101  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3207  DNA mismatch repair protein  28.94 
 
 		 665 aa  101  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000351816  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  23.22 
 
 		 632 aa  100  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0556  DNA mismatch repair protein  29 
 
 		 638 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000137773  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  22.21 
 
 		 603 aa  100  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  28.42 
 
 		 647 aa  100  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  28.42 
 
 		 647 aa  100  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  28.42 
 
 		 647 aa  100  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  28.42 
 
 		 626 aa  100  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  28.42 
 
 		 626 aa  100  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  28.42 
 
 		 647 aa  100  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  22.78 
 
 		 623 aa  100  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  28.42 
 
 		 647 aa  100  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  28.42 
 
 		 647 aa  100  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  22.78 
 
 		 623 aa  100  9e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  28.77 
 
 		 649 aa  100  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1838  DNA mismatch repair protein MutL  27.91 
 
 		 692 aa  99.8  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0019765  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  22.82 
 
 		 597 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  22.95 
 
 		 608 aa  100  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3769  DNA mismatch repair protein  28.67 
 
 		 630 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00256823  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2756  DNA mismatch repair protein  28.38 
 
 		 653 aa  99.4  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  22.78 
 
 		 566 aa  99  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3712  DNA mismatch repair protein  29 
 
 		 637 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  26.38 
 
 		 620 aa  99.4  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3976  DNA mismatch repair protein MutL  28.76 
 
 		 639 aa  99  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  27.72 
 
 		 644 aa  99.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0413  DNA mismatch repair protein  28.98 
 
 		 630 aa  99  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  27.4 
 
 		 626 aa  99.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>