More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0758 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  47.14 
 
 		 1089 aa  809    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0758  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 1028 aa  2100    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  42.91 
 
 		 1243 aa  709    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  41.33 
 
 		 1229 aa  666    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  46.34 
 
 		 1915 aa  844    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  43.79 
 
 		 1398 aa  775    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  48.85 
 
 		 1241 aa  931    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  48.43 
 
 		 1261 aa  878    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  47.49 
 
 		 1241 aa  891    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2579  glycosyl transferase group 1  50.08 
 
 		 609 aa  586  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  47.58 
 
 		 831 aa  354  4e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  39.36 
 
 		 838 aa  314  5.999999999999999e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  43.61 
 
 		 846 aa  314  5.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  43.28 
 
 		 846 aa  311  4e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2168  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.16 
 
 		 815 aa  281  4e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  37.44 
 
 		 850 aa  270  8e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2582  glycosyl transferase group 1  40.79 
 
 		 1332 aa  266  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.35538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 		 860 aa  263  1e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  35.71 
 
 		 859 aa  259  2e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  33.33 
 
 		 1219 aa  239  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  32.51 
 
 		 1232 aa  222  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0492  mannosyltransferase A  26.81 
 
 		 743 aa  179  2e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.700737  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 		 374 aa  178  5e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  32.19 
 
 		 967 aa  171  7e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  28.39 
 
 		 395 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  30.63 
 
 		 381 aa  157  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  32.43 
 
 		 386 aa  153  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 		 378 aa  152  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 		 382 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1212  glycosyl transferase group 1  30.75 
 
 		 451 aa  146  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.360145  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  29.72 
 
 		 376 aa  145  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  27.8 
 
 		 381 aa  145  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  28.12 
 
 		 381 aa  145  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0106  glycosyl transferase group 1  34.14 
 
 		 469 aa  144  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.341014  normal  0.913948 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 		 382 aa  144  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0191  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 		 779 aa  144  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 		 434 aa  144  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  30.47 
 
 		 371 aa  143  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 435 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  29.3 
 
 		 370 aa  141  7e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0218  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 		 480 aa  140  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031233  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 		 394 aa  140  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 		 394 aa  140  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0683  glycosyl transferase, group 1  32.32 
 
 		 482 aa  139  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0144645  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 400 aa  139  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 		 395 aa  139  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  31.39 
 
 		 351 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 		 408 aa  136  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  37.32 
 
 		 383 aa  136  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 		 378 aa  135  5e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 		 384 aa  135  5e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 		 385 aa  135  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  33.7 
 
 		 380 aa  134  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  28.2 
 
 		 420 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  32.17 
 
 		 397 aa  133  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 		 375 aa  132  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  32.14 
 
 		 370 aa  130  9.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  28.26 
 
 		 375 aa  130  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  28.52 
 
 		 375 aa  129  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 		 381 aa  127  9e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  33.92 
 
 		 366 aa  126  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 		 360 aa  125  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4232  glycosyl transferase, group 1  28.84 
 
 		 390 aa  125  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000972759 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 		 381 aa  125  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 		 373 aa  124  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 		 381 aa  124  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  32.72 
 
 		 382 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 		 381 aa  124  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  34.23 
 
 		 389 aa  124  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 		 373 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 		 444 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 		 377 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 		 370 aa  121  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 		 369 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 		 437 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 		 361 aa  119  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 		 366 aa  118  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 		 384 aa  116  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 		 357 aa  115  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 394 aa  115  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 		 393 aa  115  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 		 380 aa  114  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 		 382 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 		 374 aa  114  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 		 381 aa  114  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 		 382 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  29.97 
 
 		 375 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  29.66 
 
 		 375 aa  112  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 		 387 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 		 387 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1975  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 		 763 aa  112  5e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.422047  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2593  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 		 354 aa  112  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  32.05 
 
 		 431 aa  110  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  32.85 
 
 		 373 aa  110  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 		 380 aa  110  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0799  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 		 390 aa  110  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2369  glycosyl transferase, group 1  24.22 
 
 		 770 aa  108  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87241  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 		 361 aa  108  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 		 366 aa  107  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  26.8 
 
 		 374 aa  107  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>