228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0695 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0695  putative cytochrome c oxidase subunit I  100 
 
 		 201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4793  cytochrome c oxidase, subunit I  64 
 
 		 874 aa  257  7e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153175  normal  0.530231 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0168  putative cytochrome c oxidase subunit I  67.53 
 
 		 877 aa  256  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.606404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2349  putative cytochrome c oxidase subunit III protein  54.97 
 
 		 213 aa  206  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0094  putative cytochrome c oxidase subunit III protein  53.5 
 
 		 216 aa  205  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2989  putative cytochrome c oxidase subunit III protein  55.84 
 
 		 212 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181607  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5828  cytochrome c oxidase subunit III  51.27 
 
 		 200 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5242  cytochrome c oxidase subunit III  51.27 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141471  normal  0.645563 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6356  putative cytochrome c oxidase subunit III protein  51.56 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1447  cytochrome c oxidase, subunit III  36.46 
 
 		 203 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.703222  normal  0.345478 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0081  putative cytochrome c oxidase subunit III  33.5 
 
 		 217 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379927  normal  0.0255884 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2028  cytochrome c oxidase subunit III  31.22 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000242871 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  31.03 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1293  cytochrome c oxidase, subunit I  31.31 
 
 		 879 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5489  cytochrome c oxidase subunit III  31.66 
 
 		 208 aa  72  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6538  cytochrome c oxidase, subunit I  31.31 
 
 		 879 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6287  cytochrome c oxidase, subunit I  32.14 
 
 		 879 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171761  normal  0.0477153 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6573  cytochrome c oxidase, subunit I  31.63 
 
 		 882 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0983225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0458  putative cytochrome c oxidase subunit I  27.55 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  31.64 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  28.74 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2185  putative cytochrome c oxidase, subunit III  31.84 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0357507 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  26.26 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  30.15 
 
 		 962 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  30.15 
 
 		 974 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  30.51 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0944  cytochrome C oxidase subunit I  30.15 
 
 		 950 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  29.94 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  29.94 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  29.94 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0406  cytochrome c oxidase, subunit I  28.11 
 
 		 818 aa  65.9  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  26.51 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  26.51 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5501  cytochrome c oxidase, subunit I  32.11 
 
 		 876 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0931338 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  23.63 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  25.53 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  22.68 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  30.94 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3575  cytochrome c oxidase subunit III  28.05 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515089  normal  0.0102703 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  25.58 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1383  cytochrome c oxidase, subunit III  28.68 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  26.98 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  29.51 
 
 		 180 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  29.51 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  29.51 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0513  cytochrome c oxidase subunit III  25.95 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  23.98 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  29.12 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  32.33 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  28.57 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  28.42 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  25.24 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3823  cytochrome c oxidase subunit III  29.46 
 
 		 293 aa  54.7  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267917 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  29.17 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  27.32 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  26.73 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  25.58 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  26.11 
 
 		 295 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  23.98 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2853  cytochrome c oxidase subunit III  29.46 
 
 		 285 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1756  cytochrome c oxidase subunit III  25.54 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2228  cytochrome c oxidase, subunit III  29.46 
 
 		 285 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2842  cytochrome c oxidase, subunit III  29.46 
 
 		 285 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2266  cytochrome c oxidase subunit III  29.89 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  25.29 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  26.83 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0629  cytochrome c oxidase, subunit I  24.29 
 
 		 796 aa  53.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0430  cytochrome c oxidase subunit III  29.46 
 
 		 285 aa  52.8  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  27.13 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2855  cytochrome c oxidase subunit III  26.72 
 
 		 293 aa  52.8  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  29.38 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3532  cytochrome c oxidase, subunit III  26.72 
 
 		 293 aa  53.1  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.671052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6172  cytochrome c oxidase, subunit III  29.46 
 
 		 285 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0257  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  27.11 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04681  cytochrome c oxidase, subunit III  24.46 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0281  cytochrome c oxidase subunit III  28.24 
 
 		 285 aa  52  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  19.77 
 
 		 198 aa  51.6  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0606  cytochrome c oxidase subunit III  25.25 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  22.16 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  25.58 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3100  cytochrome c oxidase subunit III  26.4 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1679  cytochrome c oxidase subunit III  26.36 
 
 		 293 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3903  cytochrome c oxidase, subunit III  26.36 
 
 		 294 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0637958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0882  cytochrome c oxidase, subunit III  26.72 
 
 		 293 aa  51.2  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04991  cytochrome c oxidase, subunit III  24.46 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.487367  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  27.48 
 
 		 293 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0461  cytochrome c oxidase subunit III  28.68 
 
 		 285 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0549  cytochrome c oxidase subunit III  28.68 
 
 		 285 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2229  cytochrome c oxidase, subunit III  30.23 
 
 		 284 aa  50.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.0161512 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  21.6 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3177  putative cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  25.95 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00203621  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  23.7 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2759  cytochrome c oxidase subunit III  30.91 
 
 		 285 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.599225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4167  putative cytochrome c oxidase, subunit III  28.68 
 
 		 285 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2898  cytochrome c oxidase, subunit III  28.68 
 
 		 285 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.937469  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  28.81 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3193  cytochrome c oxidase, subunit III  27.91 
 
 		 285 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  20.34 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0443  cytochrome c oxidase, subunit III  24.46 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.547798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0512  cytochrome c oxidase, subunit III  27.91 
 
 		 285 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>