More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004392 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4861  ATP-dependent chaperone ClpB  53.99 
 
 
890 aa  906  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.806097 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2875  protein disaggregation chaperone  77.13 
 
 
857 aa  1370  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0261758  normal  0.114716 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3145  ATP-dependent chaperone ClpB  69.94 
 
 
861 aa  1233  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.263626  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4921  ATP-dependent chaperone ClpB  58.1 
 
 
879 aa  971  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289151  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1042  hypothetical protein  52.03 
 
 
867 aa  889  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1996  ATP-dependent chaperone ClpB  54.65 
 
 
866 aa  924  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3729  ATP-dependent chaperone ClpB  57.6 
 
 
874 aa  964  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2302  ATP-dependent chaperone ClpB  57.6 
 
 
874 aa  959  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409555  normal  0.0500216 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02158  ATP-dependent chaperone ClpB  68.67 
 
 
898 aa  1209  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.46606  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1210  ATP-dependent chaperone ClpB  65.05 
 
 
862 aa  1124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.890836  normal  0.0751244 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1813  ATP-dependent chaperone ClpB  65.84 
 
 
865 aa  1154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.264392 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2973  protein disaggregation chaperone  76.66 
 
 
857 aa  1363  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  8.39096e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0836  ATP-dependent chaperone ClpB  54.48 
 
 
860 aa  907  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00212148  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0938  ATP-dependent chaperone ClpB  65.54 
 
 
865 aa  1163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.651137 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0823  ATP-dependent chaperone ClpB  59.12 
 
 
865 aa  981  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457177  normal  0.714446 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1779  ATP-dependent chaperone ClpB  68.93 
 
 
861 aa  1196  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.772911  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1950  ATP-dependent chaperone ClpB  55.24 
 
 
872 aa  942  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2877  protein disaggregation chaperone  77.25 
 
 
857 aa  1370  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0185165  normal  0.16875 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2856  protein disaggregation chaperone  77.13 
 
 
857 aa  1370  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448929  normal  0.22616 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01442  ClpB protein  76.48 
 
 
824 aa  1291  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0954  ATP-dependent chaperone ClpB  57.48 
 
 
872 aa  971  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0009  ATP-dependent chaperone ClpB  53.39 
 
 
888 aa  887  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1223  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  55.53 
 
 
866 aa  941  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1907  ATP-dependent chaperone ClpB  58.26 
 
 
864 aa  978  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.442635 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3270  ATP-dependent chaperone ClpB  78.25 
 
 
857 aa  1368  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  9.97344e-05  normal  0.063711 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2646  ATP-dependent chaperone ClpB  66.59 
 
 
860 aa  1145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1327  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  55.48 
 
 
866 aa  940  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3521  ATP-dependent chaperone ClpB  57.72 
 
 
866 aa  960  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0824402  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1762  ATP-dependent chaperone ClpB  56.21 
 
 
867 aa  948  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3833  protein disaggregation chaperone  76.66 
 
 
857 aa  1364  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.68048e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0666  chaperone ClpB (heat-shock protein)  83.31 
 
 
861 aa  1481  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00205546  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1638  ATP-dependent chaperone ClpB  66.9 
 
 
866 aa  1175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  9.23416e-06 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2989  protein disaggregation chaperone  77.13 
 
 
857 aa  1370  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0921142  normal  0.947824 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2772  protein disaggregation chaperone  77.13 
 
 
857 aa  1370  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  2.79848e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0570  ATP-dependent chaperone ClpB  56.28 
 
 
864 aa  961  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.483614  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0413  ATP-dependent chaperone ClpB  57.65 
 
 
870 aa  949  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1757  ATP-dependent chaperone ClpB  66.55 
 
 
865 aa  1166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.786862  normal  0.0714253 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0453  ATP-dependent chaperone ClpB  63.67 
 
 
867 aa  1113  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  1.17348e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2019  ATP-dependent chaperone ClpB  64.66 
 
 
865 aa  1112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.82296 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1121  ATPase AAA-2 domain protein  78.25 
 
 
857 aa  1368  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0611865  normal  0.087173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4974  ATPase  56.99 
 
 
859 aa  958  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0120  ATPase  55.75 
 
 
863 aa  894  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  6.37349e-05 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0617  chaperone protein clpB  55.78 
 
 
871 aa  949  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.995797  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2696  ATPase  57.28 
 
 
862 aa  983  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0229  ATPase  56.16 
 
 
870 aa  910  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3164  ATPase  78.19 
 
 
857 aa  1372  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311114  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0886  protein disaggregation chaperone  75.73 
 
 
857 aa  1331  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  1.76912e-05  normal  0.0332416 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3497  ATPase  75.96 
 
 
857 aa  1343  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.648443  normal  0.0100947 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2878  protein disaggregation chaperone  76.66 
 
 
857 aa  1364  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000852772  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2750  protein disaggregation chaperone  76.66 
 
 
857 aa  1364  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.17665e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01007  hypothetical protein  96.73 
 
 
857 aa  1694  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0920  ATPase  58.57 
 
 
871 aa  965  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2015  ClpB  69.12 
 
 
859 aa  1196  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1902  ATPase  56.63 
 
 
879 aa  963  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.243846  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1751  ATPase  57.31 
 
 
880 aa  976  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3819  ATP-dependent chaperone ClpB  52.97 
 
 
861 aa  912  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0624258  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5207  ATP-dependent chaperone ClpB  65.89 
 
 
870 aa  1132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1426  ATP-dependent chaperone ClpB  66.04 
 
 
865 aa  1161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.814742  hitchhiker  0.00462707 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1850  ATP-dependent Clp protease subunit  69.04 
 
 
861 aa  1201  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.808048  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5085  ATP-dependent chaperone ClpB  56.99 
 
 
878 aa  956  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1871  ATP-dependent chaperone ClpB  65.77 
 
 
865 aa  1166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914514  hitchhiker  0.00068735 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3720  ATP-dependent chaperone ClpB  78.17 
 
 
857 aa  1372  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00907871  normal  0.367074 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5444  ATP-dependent chaperone ClpB  57.89 
 
 
874 aa  964  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4545  ATP-dependent chaperone ClpB  68.58 
 
 
854 aa  1224  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822332  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2746  protein disaggregation chaperone  76.66 
 
 
857 aa  1364  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00462147  normal  0.181562 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1089  protein disaggregation chaperone  76.66 
 
 
857 aa  1364  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  8.60565e-06  decreased coverage  6.35783e-07 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3349  protein disaggregation chaperone  76.2 
 
 
857 aa  1334  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.33942e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0452  ATPase  57.14 
 
 
862 aa  952  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0991  ATP-dependent chaperone ClpB  56 
 
 
864 aa  963  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462361  normal  0.380293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0671  ATP-dependent chaperone ClpB  68.93 
 
 
854 aa  1204  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1077  ATPase  55.44 
 
 
866 aa  938  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2346  ATP-dependent chaperone ClpB  57.72 
 
 
874 aa  963  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.325239 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3475  protein disaggregation chaperone  76.2 
 
 
857 aa  1334  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000223362  normal  0.392358 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0179  ATP-dependent chaperone ClpB  69.12 
 
 
859 aa  1195  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1604  ATPase  54.39 
 
 
863 aa  932  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.234321  normal  0.194925 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2309  ATP-dependent chaperone ClpB  56.13 
 
 
872 aa  973  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2465  ATP-dependent chaperone ClpB  55.38 
 
 
880 aa  929  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004392  ClpB protein  100 
 
 
857 aa  1735  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000934943  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4437  ATP-dependent chaperone ClpB  54.06 
 
 
876 aa  901  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4102  ATP-dependent chaperone ClpB  55.5 
 
 
850 aa  911  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5924  ATP-dependent chaperone ClpB  54.69 
 
 
880 aa  904  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2027  ATP-dependent chaperone ClpB  72.12 
 
 
860 aa  1262  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000180597  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1138  protein disaggregation chaperone  75.15 
 
 
858 aa  1342  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0178094  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1601  ATP-dependent chaperone ClpB  55.79 
 
 
864 aa  907  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5193  ATP-dependent chaperone ClpB  55.18 
 
 
874 aa  909  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1858  ATP-dependent chaperone ClpB  55.9 
 
 
866 aa  942  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  2.17935e-08  normal  0.0630918 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2007  ATP-dependent chaperone ClpB  54.31 
 
 
863 aa  932  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.324235  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3068  ATP-dependent chaperone ClpB  56.16 
 
 
887 aa  933  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0100  ATP-dependent chaperone ClpB  55.27 
 
 
860 aa  900  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.373648 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0287  ATP-dependent chaperone ClpB  56.57 
 
 
864 aa  935  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00690  ATP-dependent chaperone ClpB  56.08 
 
 
871 aa  929  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01200  ATP-dependent chaperone ClpB  54.38 
 
 
891 aa  903  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0234  ATP-dependent chaperone ClpB  55.93 
 
 
863 aa  904  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1077  ATP-dependent chaperone ClpB  55.79 
 
 
871 aa  942  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  1.52857e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1216  ATP-dependent chaperone ClpB  58.18 
 
 
867 aa  971  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09888  putative heat shock ClpB protein  53.1 
 
 
893 aa  915  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0416  ATP-dependent chaperone ClpB  58.81 
 
 
855 aa  959  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0483677 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5467  ATP-dependent chaperone ClpB  55.12 
 
 
871 aa  909  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.184424  normal  0.486747 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0243  ATP-dependent chaperone ClpB  56.39 
 
 
861 aa  919  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0494  ATP-dependent chaperone ClpB  55.83 
 
 
846 aa  938  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>