More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2851 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02482  protein disaggregation chaperone  59.44 
 
 
857 aa  1018    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000328184  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1080  ATP-dependent chaperone ClpB  59.44 
 
 
857 aa  1018    Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000145981  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0658  ClpB protein  88.67 
 
 
865 aa  1546    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0625  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  57.95 
 
 
854 aa  954    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0977659  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1118  clpB protein  57.93 
 
 
863 aa  964    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2327  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  60.16 
 
 
859 aa  1026    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3106  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  58.25 
 
 
859 aa  988    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652443  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0224  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  54.38 
 
 
853 aa  934    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.230027  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1335  ATP-dependent protease  57.19 
 
 
862 aa  964    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.255547  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1287  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  56.59 
 
 
866 aa  971    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3913  ATP-dependent chaperone protein ClpB  56.73 
 
 
861 aa  974    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1864  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  58.51 
 
 
874 aa  1003    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3577  clpB protein  58.41 
 
 
857 aa  990    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0829  clpB protein  57.73 
 
 
854 aa  974    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1090  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpB  56.43 
 
 
866 aa  972    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.930784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1072  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  56.31 
 
 
866 aa  971    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1066  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  56.54 
 
 
866 aa  960    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.226662  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1377  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  56.83 
 
 
865 aa  978    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  60.26 
 
 
858 aa  1034    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  60.38 
 
 
858 aa  1036    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0728  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:Clp, N terminal  57.97 
 
 
854 aa  976    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803675  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0823  putative chaperonin clpA/B  55.49 
 
 
865 aa  939    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00549001 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2727  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  57.18 
 
 
863 aa  981    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.286656  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0200  ATPase  59.86 
 
 
867 aa  1008    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.371355  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1980  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  58.25 
 
 
862 aa  988    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.192819  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0815  ClpB protein  57.61 
 
 
859 aa  951    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0589  AAA ATPase  57.68 
 
 
891 aa  993    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.917819  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0132  ATPase  58.61 
 
 
873 aa  1012    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0140  ATPase  54.26 
 
 
876 aa  956    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.182889  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2335  ATPase  57.19 
 
 
872 aa  1015    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2389  ClpB heat-shock protein  56.94 
 
 
865 aa  979    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2381  ATP-dependent Clp protease  58.84 
 
 
865 aa  1005    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4834  chaperone clpB  57.8 
 
 
854 aa  969    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0201945  normal  0.188995 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1408  chaperone ClpB  58.91 
 
 
870 aa  982    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0359  heat shock protein ClpB-like  57.32 
 
 
872 aa  966    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5148  AAA ATPase, ClpB  57.06 
 
 
865 aa  981    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.830586  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0911  ATPase  56.49 
 
 
862 aa  983    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1007  ATPase  57.3 
 
 
862 aa  974    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.783787 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2851  AAA ATPase  100 
 
 
864 aa  1735    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000473406  hitchhiker  0.00000000124432 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1661  ATPase  57.19 
 
 
863 aa  949    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0414  AAA ATPase  57.14 
 
 
854 aa  960    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.817995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1177  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpB  56.43 
 
 
866 aa  972    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1089  ATPase  56.71 
 
 
883 aa  990    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000277828 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1541  ATPase with chaperone activity  57.64 
 
 
869 aa  979    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0753  chaperone clpB  57.73 
 
 
870 aa  1008    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2205  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  56.94 
 
 
865 aa  982    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.489947  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0385  AAA ATPase, ClpA/B  62.24 
 
 
870 aa  1047    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4356  ATPase AAA-2  56.4 
 
 
869 aa  948    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.508325 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4247  AAA_5 ATPase  57.59 
 
 
879 aa  999    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0997657  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2824  AAA ATPase, central region  57.08 
 
 
859 aa  999    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.553525  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1289  ATPase AAA-2  55.88 
 
 
865 aa  959    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00235636  normal  0.153454 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3987  ATPase AAA-2  56.53 
 
 
871 aa  977    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598394  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1919  ATPase AAA-2  57.53 
 
 
870 aa  977    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.494579  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2548  ClpB protein  56.98 
 
 
876 aa  965    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184883 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4277  ATPase AAA-2  58.51 
 
 
879 aa  991    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345892  normal  0.036292 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2198  ATPase AAA-2  58.36 
 
 
861 aa  998    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.105301  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2201  ATPase AAA-2  57.63 
 
 
866 aa  958    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.755667  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2374  heat-shock protein, chaperone ClpB  56.59 
 
 
865 aa  977    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0849473  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2861  ATPase AAA-2  57.43 
 
 
862 aa  976    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.133285  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2199  ATPase AAA-2  56.44 
 
 
869 aa  983    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0278692  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4095  ATPase AAA-2  57.45 
 
 
879 aa  986    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141008  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0499  ATPase AAA-2  58.06 
 
 
860 aa  991    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333931  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0681  ATPase AAA-2  57.8 
 
 
878 aa  979    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.310186  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0841  ATPase AAA-2  55.61 
 
 
865 aa  942    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1959  ATPase AAA-2  56.96 
 
 
862 aa  976    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0199054  normal  0.312929 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0194  ATP-dependent chaperone protein ClpB  54.53 
 
 
862 aa  929    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.68228  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4765  ATPase AAA-2  61.97 
 
 
878 aa  1090    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000533628  normal  0.0145469 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1210  ATPase AAA-2  57.63 
 
 
861 aa  941    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0522971  normal  0.881937 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0130  ATPase AAA-2  57.41 
 
 
872 aa  970    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581017  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0406  ATPase AAA-2  57.46 
 
 
862 aa  985    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2391  ATPase AAA-2  58.58 
 
 
859 aa  1012    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6232  ATPase AAA-2  57.29 
 
 
865 aa  985    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0478  ATPase AAA-2  59.88 
 
 
848 aa  1019    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1337  ATPase AAA-2  55.96 
 
 
858 aa  955    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184939  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2996  ATPase AAA-2  56.99 
 
 
891 aa  971    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0199  ATP-dependent Clp protease, subunit B  58.64 
 
 
856 aa  985    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0543  ATPase AAA-2  57.21 
 
 
870 aa  1008    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0110246  normal  0.574025 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2991  ATPase  58.23 
 
 
857 aa  989    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00302942  normal  0.61786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3072  ATPase  58.23 
 
 
857 aa  989    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0239882  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2558  ATPase  58.91 
 
 
864 aa  1015    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.111038  hitchhiker  0.00562869 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0669  ATPase  57.43 
 
 
865 aa  981    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0949399  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0493  ATPase  59.48 
 
 
864 aa  987    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0650  ATPase  58.02 
 
 
868 aa  991    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.557806 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1785  ATPase  57.28 
 
 
865 aa  982    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60190  clpB protein  58.78 
 
 
854 aa  994    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00250267  hitchhiker  0.00000000231015 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3740  ATPase  57.33 
 
 
889 aa  979    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1847  ATPase  57.29 
 
 
865 aa  985    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0263  ATPase  57.46 
 
 
873 aa  967    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.602009  normal  0.916411 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0147  ATPase  59.4 
 
 
861 aa  976    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.919618  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3169  ATPase  58.23 
 
 
857 aa  989    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00027679  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2119  ATPase  60.19 
 
 
864 aa  1002    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299274  normal  0.0630262 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1737  ATPase  56.01 
 
 
873 aa  954    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0062  ATPase  55.98 
 
 
875 aa  988    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294718  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4357  ATPase  57.13 
 
 
866 aa  968    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.427241  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2603  clpB protein  58.33 
 
 
857 aa  999    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0399134  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0489  ATPase  59.88 
 
 
848 aa  1019    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3263  chaperone ClpB  56.61 
 
 
857 aa  960    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0659  ATPase  59.81 
 
 
848 aa  1019    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.582128 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0880  ATPase  58.24 
 
 
859 aa  999    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0343543  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1290  ATPase  56.44 
 
 
865 aa  944    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.851585  normal  0.196036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>