258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001440 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  100 
 
 
236 aa  470  1e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  82.55 
 
 
247 aa  398  1e-110  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1188  putative branched-chain amino acid transport protein  76.39 
 
 
237 aa  361  7e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  70.67 
 
 
239 aa  323  1e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  58.22 
 
 
285 aa  278  5e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  58.22 
 
 
273 aa  278  6e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  58.22 
 
 
273 aa  277  8e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  57.78 
 
 
273 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  57.33 
 
 
293 aa  271  7e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  57.33 
 
 
255 aa  267  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  57.99 
 
 
255 aa  264  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  57.66 
 
 
286 aa  261  9e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  54.79 
 
 
238 aa  254  7e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  57.01 
 
 
231 aa  254  8e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  56.34 
 
 
230 aa  252  4e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  53.21 
 
 
245 aa  244  1e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  48.07 
 
 
252 aa  238  7e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  49.09 
 
 
247 aa  234  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3299  AzlC-like  51.58 
 
 
232 aa  226  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1897  AzlC family protein  48.92 
 
 
233 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3310  AzlC family protein  50.46 
 
 
230 aa  216  3e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294738  normal  0.172837 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2385  AzlC family protein  50.46 
 
 
230 aa  216  3e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1991  AzlC family protein  50.46 
 
 
230 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.823633  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2854  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  44.84 
 
 
242 aa  203  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.608526  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  41.96 
 
 
244 aa  187  9e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  41.07 
 
 
244 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2443  branched-chain amino acid exporter, LIV- E family  42.2 
 
 
246 aa  184  2e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1356  AzlC family protein  41.81 
 
 
246 aa  182  5e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  39.46 
 
 
244 aa  152  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  37.33 
 
 
258 aa  150  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  40.8 
 
 
249 aa  133  2e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  38.05 
 
 
253 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  34.25 
 
 
250 aa  130  1e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  38.3 
 
 
253 aa  130  2e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  40.32 
 
 
255 aa  130  2e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  5.58659e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  37 
 
 
255 aa  130  2e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  41.24 
 
 
292 aa  129  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  41.24 
 
 
257 aa  128  7e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  1.53015e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  41.24 
 
 
257 aa  128  7e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  40.68 
 
 
255 aa  128  8e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  2.3066e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  40.68 
 
 
280 aa  128  1e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  40.68 
 
 
250 aa  127  1e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  32.89 
 
 
228 aa  116  4e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  30.89 
 
 
265 aa  114  1e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  29.57 
 
 
246 aa  111  1e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  30.73 
 
 
257 aa  110  1e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  30.77 
 
 
242 aa  110  1e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  34.35 
 
 
243 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  34.9 
 
 
247 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  30.7 
 
 
242 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  29.82 
 
 
228 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  30.39 
 
 
244 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  31.74 
 
 
242 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  29.18 
 
 
235 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  30.8 
 
 
234 aa  99.4  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  32.62 
 
 
233 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  29.5 
 
 
229 aa  94.4  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  28.27 
 
 
235 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  28.27 
 
 
235 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0661  AzlC family protein  33.52 
 
 
239 aa  92.4  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0710886  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  31.44 
 
 
240 aa  92.4  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  30.67 
 
 
241 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  30.67 
 
 
241 aa  92  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  30.67 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  30.67 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  30.67 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  30.22 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  30.22 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  29.78 
 
 
241 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  30.22 
 
 
241 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  30.29 
 
 
233 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0768  AzlC family protein  29.89 
 
 
234 aa  90.1  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.390341  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  31.25 
 
 
242 aa  89.7  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1603  AzlC family protein  31.71 
 
 
238 aa  89  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315939  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0311  AzlC family protein  31.07 
 
 
238 aa  89  6e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1025  AzlC family protein  32.99 
 
 
238 aa  89  7e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0979622  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  32.54 
 
 
247 aa  88.2  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  30.04 
 
 
234 aa  86.7  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1048  AzlC family protein  33.16 
 
 
239 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  28.12 
 
 
242 aa  86.3  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1477  AzlC family protein  34.29 
 
 
238 aa  84.3  1e-15  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01830  AzlC family protein  31.58 
 
 
236 aa  84  2e-15  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.79674  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  29.17 
 
 
245 aa  83.6  2e-15  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.862263 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  26.34 
 
 
240 aa  82.8  4e-15  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  28.51 
 
 
240 aa  83.2  4e-15  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  30.36 
 
 
233 aa  82.8  4e-15  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1756  AzlC family protein  28.9 
 
 
240 aa  82.4  5e-15  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0944  AzlC family protein  26.92 
 
 
235 aa  82.8  5e-15  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.77629e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  33.91 
 
 
242 aa  82.4  5e-15  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  29.65 
 
 
240 aa  82.4  6e-15  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1744  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  31.98 
 
 
231 aa  81.6  8e-15  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.260158  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1426  AzlC-like protein  29.29 
 
 
244 aa  82  8e-15  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  2.61082e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0158  AzlC family protein  33.51 
 
 
307 aa  81.6  1e-14  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00265817  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0732  AzlC family protein  34.15 
 
 
217 aa  80.1  2e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100734  normal  0.28736 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  30.59 
 
 
240 aa  80.1  3e-14  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  30.41 
 
 
244 aa  80.1  3e-14  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  27.35 
 
 
258 aa  79  6e-14  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0893  AzlC family protein  29.15 
 
 
250 aa  78.6  8e-14  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4248  AzlC family protein  28.83 
 
 
237 aa  77.8  1e-13  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0194  AzlC family protein  31.46 
 
 
235 aa  77.4  2e-13  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.422713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>