More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1196 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
289 aa  591  1e-168  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2871  Rieske (2Fe-2S) region  35.71 
 
 
292 aa  176  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.45 
 
 
296 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  31.21 
 
 
315 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4533  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.42 
 
 
294 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441672  normal  0.86514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4812  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.65 
 
 
304 aa  151  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.36 
 
 
322 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4823  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  33.86 
 
 
285 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0232  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.65 
 
 
303 aa  139  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0333  Rieske (2Fe-2S) protein  33.56 
 
 
298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4736  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32 
 
 
293 aa  136  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0513  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  30.9 
 
 
303 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0819  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.77 
 
 
294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  26.8 
 
 
270 aa  97.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1919  hypothetical protein  43.31 
 
 
221 aa  96.7  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90171  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.99 
 
 
277 aa  94.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02690  hypothetical protein  42.73 
 
 
224 aa  88.6  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1579  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1433  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  35.71 
 
 
604 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.44 
 
 
521 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  36.91 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  36.91 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  35.62 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2739  hypothetical protein  30.99 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1112  hypothetical protein  29.94 
 
 
195 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.900973  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20170  hypothetical protein  28.19 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0976183  normal  0.0396109 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01479  dioxygenase, ferredoxin reductase component, putative  33.71 
 
 
559 aa  68.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2821  Rieske (2Fe-2S) region  30 
 
 
102 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3175  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.09 
 
 
506 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0759164  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2226  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.95 
 
 
114 aa  67  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000457155  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2693  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.18 
 
 
506 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.563055  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1329  putative dioxygenase, ferredoxin reductase component  32.65 
 
 
521 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0248077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1008  hypothetical protein  28.81 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2675  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.55 
 
 
506 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148641  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1987  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.1 
 
 
108 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2541  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.68 
 
 
506 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5941  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.05 
 
 
526 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0250  hypothetical protein  30.71 
 
 
189 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0260  hypothetical protein  30.71 
 
 
189 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.075822  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0270  hypothetical protein  30.71 
 
 
189 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
105 aa  64.7  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.165892 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1038  hypothetical protein  29.76 
 
 
180 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0914  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.35 
 
 
518 aa  63.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0455  Rieske (2Fe-2S) region  42.03 
 
 
108 aa  63.2  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03310  conserved hypothetical protein  27.54 
 
 
585 aa  62.8  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6175  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.4 
 
 
593 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0659991  hitchhiker  0.00257919 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3656  Rieske (2Fe-2S) region  29.67 
 
 
105 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.747877  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5589  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.67 
 
 
105 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587987 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4711  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.67 
 
 
105 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.938131  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1103  Rieske (2Fe-2S) protein  29.67 
 
 
105 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476425  normal  0.326175 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2249  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  33.33 
 
 
127 aa  62  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.8 
 
 
137 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.18886 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4349  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.14 
 
 
516 aa  62  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.504096  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3982  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.67 
 
 
105 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0367029 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09103  apoptosis-inducing factor (Eurofung)  37.18 
 
 
561 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0266985  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.21 
 
 
105 aa  60.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.37 
 
 
509 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529445  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2708  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.25 
 
 
107 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5285  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.48 
 
 
521 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1232  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.57 
 
 
105 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0124  hypothetical protein  29.24 
 
 
171 aa  60.1  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1338  naphthalene 1,2-dioxygenase system ferredoxin component  28.57 
 
 
105 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872244  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1586  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.25 
 
 
107 aa  60.1  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5579  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.51 
 
 
594 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2492  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
105 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4570  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.38 
 
 
105 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0919723  hitchhiker  0.000210645 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0597  naphthalene 1,2-dioxygenase system ferredoxin component  28.57 
 
 
105 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0893389  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2961  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  37.35 
 
 
111 aa  60.1  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0970  naphthalene 1,2-dioxygenase system ferredoxin component  28.57 
 
 
105 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0321  naphthalene 1,2-dioxygenase system ferredoxin component  28.57 
 
 
105 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.23021  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4105  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.38 
 
 
105 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1305  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.57 
 
 
105 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.935545  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1503  naphthalene 1,2-dioxygenase system ferredoxin component  28.57 
 
 
105 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3123  Rieske (2Fe-2S) protein  32.35 
 
 
349 aa  59.7  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00337014  normal  0.164048 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0566  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.17 
 
 
523 aa  59.7  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4275  Rieske (2Fe-2S) region  34.57 
 
 
106 aa  59.7  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.32 
 
 
99 aa  58.9  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0987  Rieske 2Fe-2S family protein  29.07 
 
 
106 aa  58.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0893  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.42 
 
 
504 aa  58.5  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0538  Rieske (2Fe-2S) region  42.47 
 
 
131 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520467  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2673  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.68 
 
 
649 aa  58.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3120  pyruvate oxidase  32.38 
 
 
656 aa  58.9  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.777401  normal  0.194873 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  30.56 
 
 
175 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3308  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.47 
 
 
513 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1258  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.56 
 
 
119 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0240354  hitchhiker  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2087  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.78 
 
 
118 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.35 
 
 
106 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149896  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  29.9 
 
 
238 aa  57.4  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0236  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  28.57 
 
 
109 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2705  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  28.57 
 
 
109 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0205  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.57 
 
 
109 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1985  putative dioxygenase  35.37 
 
 
110 aa  57.4  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0981  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.57 
 
 
109 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1380  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  28.57 
 
 
109 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.186781  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3441  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.51 
 
 
599 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2741  cytochrome P450  33 
 
 
599 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25917  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1577  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  28.57 
 
 
109 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.869936  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2561  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  28.57 
 
 
109 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3956  Rieske (2Fe-2S) protein  38.24 
 
 
105 aa  57  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0167  Rieske (2Fe-2S) region  34.57 
 
 
119 aa  56.6  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0167  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.15 
 
 
109 aa  56.6  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000930652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>