185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0997 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0997  galactokinase  100 
 
 
362 aa  717  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00864415  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10631  galactokinase  53.95 
 
 
363 aa  305  9e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00193784  normal  0.94952 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  48.04 
 
 
389 aa  273  3e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  46.34 
 
 
391 aa  273  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  45.45 
 
 
349 aa  257  3e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  44.44 
 
 
394 aa  256  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  44.88 
 
 
401 aa  250  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  41.1 
 
 
385 aa  249  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  44.63 
 
 
395 aa  248  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2607  galactokinase  44.76 
 
 
399 aa  240  3e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00377614  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  44.95 
 
 
387 aa  239  7e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  42.03 
 
 
383 aa  238  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  41.85 
 
 
372 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4206  galactokinase  46.69 
 
 
376 aa  235  8e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  34.65 
 
 
386 aa  235  9e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  36.44 
 
 
355 aa  234  2e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  43.08 
 
 
359 aa  234  2e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  40.83 
 
 
382 aa  232  9e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2490  galactokinase  48.53 
 
 
409 aa  231  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  39.94 
 
 
382 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  39.94 
 
 
382 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  39.94 
 
 
382 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  39.94 
 
 
382 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  40.48 
 
 
385 aa  229  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  39.05 
 
 
393 aa  229  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  40.27 
 
 
379 aa  229  6e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  39.66 
 
 
382 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  38.63 
 
 
403 aa  229  7e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  39.94 
 
 
382 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  43.11 
 
 
349 aa  228  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2960  galactokinase  44.48 
 
 
407 aa  228  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0133618  decreased coverage  0.000169773 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  39.94 
 
 
382 aa  227  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  39.94 
 
 
382 aa  227  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  39.94 
 
 
382 aa  227  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  38.65 
 
 
405 aa  227  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  39.94 
 
 
382 aa  227  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  38.89 
 
 
386 aa  227  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  38.75 
 
 
386 aa  227  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0758  galactokinase  44.07 
 
 
429 aa  226  6e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.558541  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  39.66 
 
 
382 aa  225  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  35.94 
 
 
389 aa  224  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7279  galactokinase  42.32 
 
 
418 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  39.95 
 
 
392 aa  224  2e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4056  galactokinase  44.51 
 
 
403 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37616  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  39.39 
 
 
382 aa  224  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4902  galactokinase  44.82 
 
 
379 aa  221  1e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  39.01 
 
 
391 aa  221  2e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  39.55 
 
 
387 aa  219  5e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  42.05 
 
 
383 aa  219  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  42.05 
 
 
383 aa  219  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  42.05 
 
 
383 aa  219  7e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  39.12 
 
 
391 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  44.2 
 
 
383 aa  218  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  37.68 
 
 
358 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  40.94 
 
 
389 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  42.56 
 
 
383 aa  216  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  34.1 
 
 
395 aa  215  7e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  34.9 
 
 
387 aa  215  8e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  37.87 
 
 
350 aa  215  1e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  37.87 
 
 
350 aa  215  1e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  36.19 
 
 
404 aa  214  2e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  34.16 
 
 
387 aa  213  6e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  41.23 
 
 
369 aa  212  9e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  40.92 
 
 
388 aa  210  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  1.98069e-10 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2211  galactokinase  39.74 
 
 
414 aa  210  4e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.173587  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0973  galactokinase  38.57 
 
 
416 aa  210  4e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32880  galactokinase  42.63 
 
 
409 aa  209  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226542  normal  0.212245 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  30.87 
 
 
380 aa  209  7e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  37.14 
 
 
405 aa  206  4e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  38.86 
 
 
400 aa  206  4e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  1.14591e-05 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  32.19 
 
 
351 aa  206  6e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  38.64 
 
 
385 aa  206  6e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  37.4 
 
 
388 aa  205  9e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  38.76 
 
 
392 aa  205  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  34.91 
 
 
394 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  37.74 
 
 
412 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3973  galactokinase  41.49 
 
 
408 aa  204  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.340727 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24040  galactokinase  41.53 
 
 
420 aa  203  4e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  40.88 
 
 
387 aa  202  1e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  37.74 
 
 
409 aa  202  1e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  39.31 
 
 
384 aa  201  2e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  38.91 
 
 
356 aa  200  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  41.79 
 
 
373 aa  200  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  37.74 
 
 
385 aa  199  4e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  39.09 
 
 
388 aa  199  9e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  3.83534e-06 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  40.11 
 
 
387 aa  198  2e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  39.35 
 
 
398 aa  197  2e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  32.55 
 
 
392 aa  198  2e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  37.84 
 
 
357 aa  196  7e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  32.97 
 
 
387 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  39.45 
 
 
414 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  39.48 
 
 
376 aa  194  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  31.9 
 
 
387 aa  193  4e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  34.16 
 
 
394 aa  193  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  33.24 
 
 
384 aa  192  8e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  34.05 
 
 
390 aa  191  2e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  35.33 
 
 
388 aa  190  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0544  galactokinase  43.58 
 
 
380 aa  190  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  33.7 
 
 
397 aa  189  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4682  galactokinase  42.86 
 
 
424 aa  189  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>