58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1683 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  100 
 
 		 456 aa  903    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  70.42 
 
 		 456 aa  673    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1345  ATPase  56.98 
 
 		 456 aa  511  1e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  35.06 
 
 		 462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2667  DUF234 DEXX-box ATPase  31.03 
 
 		 478 aa  202  7e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.578936 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  32.83 
 
 		 461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  33.05 
 
 		 463 aa  187  5e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1025  ATPase  31.7 
 
 		 454 aa  173  5e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.656086  normal  0.0180232 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  27.17 
 
 		 471 aa  172  7.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0415  ATPase  31.86 
 
 		 476 aa  171  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.336627  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  29.46 
 
 		 464 aa  168  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  29.02 
 
 		 460 aa  167  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  30.52 
 
 		 431 aa  166  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  28.11 
 
 		 464 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  29.06 
 
 		 443 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  28.95 
 
 		 463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1193  ATPase  26.83 
 
 		 457 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.460644  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  28.39 
 
 		 462 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  25.1 
 
 		 474 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  29.65 
 
 		 454 aa  160  5e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  27.39 
 
 		 450 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  29.69 
 
 		 457 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  28.14 
 
 		 470 aa  152  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1429  putative AAA+ superfamily ATPase  28.3 
 
 		 473 aa  152  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541066  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2275  ATPase  26.43 
 
 		 496 aa  147  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1177  ATPase  29.22 
 
 		 407 aa  145  1e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  25.39 
 
 		 460 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  25.22 
 
 		 469 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  31.65 
 
 		 420 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  25.68 
 
 		 458 aa  138  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1537  ATPase  27.06 
 
 		 464 aa  139  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  26.32 
 
 		 469 aa  137  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0874  ATPase  26.41 
 
 		 456 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0559719  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  28.29 
 
 		 439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  23.71 
 
 		 463 aa  126  6e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2218  ATPase  26.28 
 
 		 463 aa  126  9e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2620  ATPase  24.36 
 
 		 487 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1446  ATPase  27.84 
 
 		 439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.239907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1424  ATPase  23.65 
 
 		 472 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846928  normal  0.285417 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10540  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  21.04 
 
 		 509 aa  85.9  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000147633  hitchhiker  0.0000000237286 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2879  ATPase  20.3 
 
 		 470 aa  80.9  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  21.03 
 
 		 472 aa  77.4  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4522  ATPase  19.87 
 
 		 480 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2557  ATPase  23.12 
 
 		 485 aa  69.7  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.928709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8891  hypothetical protein  21.54 
 
 		 501 aa  67.4  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02740  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  21.19 
 
 		 474 aa  60.1  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2379  ATPase  26.05 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0397  ATPase  28.82 
 
 		 277 aa  52.8  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1841  DUF234 DEXX-box ATPase  23.08 
 
 		 313 aa  52.8  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0384  ATPase  25.63 
 
 		 361 aa  52.4  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.000000176931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0594  conserved hypothetical protein (DUF234 domain protein)  26.53 
 
 		 283 aa  52  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000231419  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0500  ATPase  26.6 
 
 		 279 aa  51.2  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1739  ATPase  24.6 
 
 		 383 aa  47.4  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1584  ATPase  23.71 
 
 		 356 aa  45.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0081  ATPase  29.46 
 
 		 307 aa  45.4  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00107547  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0853  ATPase  24.88 
 
 		 844 aa  44.7  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2114  DUF234 DEXX-box ATPase  26.59 
 
 		 304 aa  43.9  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1933  ATPase  25 
 
 		 356 aa  43.5  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0359991  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>