30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0220 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0220  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  636    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0184  hypothetical protein  29.66 
 
 		 358 aa  140  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0873  hypothetical protein  28.37 
 
 		 321 aa  112  6e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0739  hypothetical protein  31.67 
 
 		 351 aa  112  9e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0465  hypothetical protein  28.36 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0450  integral membrane protein-like protein  28.36 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00950527  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1924  hypothetical protein  26.62 
 
 		 323 aa  97.1  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00284727  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  25.79 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1439  hypothetical protein  26.58 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  29.19 
 
 		 347 aa  72.4  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  26.87 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1587  integral membrane protein  25.57 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.029359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  24.9 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  25.81 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  27.34 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  28.66 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1959  hypothetical protein  22.8 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000013815  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  24.75 
 
 		 346 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  25.46 
 
 		 347 aa  54.7  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  22.86 
 
 		 352 aa  52.8  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  23.08 
 
 		 342 aa  50.4  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1084  hypothetical protein  25.2 
 
 		 353 aa  50.1  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1365  hypothetical protein  21.78 
 
 		 374 aa  49.3  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2409  hypothetical protein  24.02 
 
 		 342 aa  49.3  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.753908  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  24.56 
 
 		 338 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  29.9 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1853  hypothetical protein  21.26 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0126154  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1980  hypothetical protein  20.75 
 
 		 341 aa  44.3  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335213  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1101  hypothetical protein  19.58 
 
 		 347 aa  44.3  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0490804  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0043  hypothetical protein  22.73 
 
 		 363 aa  43.1  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>