211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_5012 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_5012  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  100 
 
 
299 aa  615  1e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.915313  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2668  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  62.89 
 
 
296 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4498  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  61.17 
 
 
297 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4434  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  60.82 
 
 
297 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5153  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  61.3 
 
 
304 aa  366  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4290  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  60.82 
 
 
299 aa  364  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2396  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  61.81 
 
 
296 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.309773  normal  0.445345 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1963  hypothetical protein  53.31 
 
 
298 aa  308  8e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06571  putative carboxypeptidase  47.14 
 
 
299 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1741  hypothetical protein  44.55 
 
 
303 aa  226  5.0000000000000005e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0621  hypothetical protein  45.61 
 
 
294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.859516  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1787  hypothetical protein  40.68 
 
 
291 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1854  hypothetical protein  41.1 
 
 
317 aa  210  3e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05101  putative carboxypeptidase  39.8 
 
 
291 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.252478 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0799  hypothetical protein  40.75 
 
 
321 aa  204  2e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04561  putative carboxypeptidase  42.52 
 
 
300 aa  203  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0455  hypothetical protein  37.25 
 
 
289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.517276  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05111  putative carboxypeptidase  37.5 
 
 
289 aa  199  5e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0583288  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04801  putative carboxypeptidase  37.16 
 
 
289 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.957577  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05181  putative carboxypeptidase  35.47 
 
 
290 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.171155  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17261  hypothetical protein  42.26 
 
 
299 aa  186  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3395  peptidase S66, LD-carboxypeptidase A  36.84 
 
 
321 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4176  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  36.33 
 
 
357 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4910  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.97 
 
 
310 aa  179  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128851  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0854  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  36.09 
 
 
312 aa  178  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3542  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.27 
 
 
321 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3478  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.27 
 
 
321 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0711  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  38.18 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374689  normal  0.0271624 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3582  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  37.42 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3460  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.64 
 
 
311 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0181696 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1838  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  33.44 
 
 
311 aa  168  8e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.396505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3337  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  36.16 
 
 
309 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0590  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.55 
 
 
305 aa  165  8e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00406541  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1871  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  34.23 
 
 
313 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3393  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.89 
 
 
344 aa  159  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3374  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.05 
 
 
341 aa  156  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.511147 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0123  hypothetical protein  32.43 
 
 
297 aa  152  7e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0687  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.79 
 
 
305 aa  152  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000215417  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1087  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.35 
 
 
305 aa  152  8e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4962  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  34.77 
 
 
315 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1985  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.89 
 
 
339 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1956  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.11 
 
 
319 aa  151  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131813 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2030  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  34.28 
 
 
333 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.630907  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5403  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.06 
 
 
285 aa  148  8e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.381396 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0548  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  33.44 
 
 
297 aa  147  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0029  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  33 
 
 
316 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259405  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1289  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  29.97 
 
 
306 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1418  hypothetical protein  29.28 
 
 
306 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2258  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.92 
 
 
363 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000465368 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1482  hypothetical protein  28.95 
 
 
306 aa  142  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1525  hypothetical protein  28.62 
 
 
306 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1664  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34 
 
 
292 aa  142  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191805  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0622  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.1 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1254  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  28.62 
 
 
306 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6755  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.78 
 
 
315 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3925  hypothetical protein  28.62 
 
 
306 aa  139  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1282  hypothetical protein  27.83 
 
 
306 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1384  hypothetical protein  27.83 
 
 
306 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.202295  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3454  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.61 
 
 
300 aa  139  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000129902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1256  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  27.51 
 
 
306 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1456  hypothetical protein  27.83 
 
 
306 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.946186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2712  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.47 
 
 
310 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4852  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.33 
 
 
312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6860  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.43 
 
 
348 aa  136  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143342 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2200  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30 
 
 
339 aa  136  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.498556  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4799  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  33.67 
 
 
312 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.26616 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4674  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  34.01 
 
 
312 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0745  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.67 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1218  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  31.03 
 
 
299 aa  133  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.190854  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3416  carboxypeptidase  29.45 
 
 
292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4926  twin-arginine translocation pathway signal  31.61 
 
 
361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0019  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  32.66 
 
 
316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3212  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.23 
 
 
325 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4524  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.33 
 
 
309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1921  L,D-carboxypeptidase A  31.54 
 
 
308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.271346 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2333  L,D-carboxypeptidase A  32.24 
 
 
308 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.602476 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0601  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.13 
 
 
348 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.62332  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0027  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  30.77 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4176  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.03 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7092  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  30.11 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2768  LD-carboxypeptidase family protein  29.87 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2453  mccF-like protein  29.53 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04130  putative carboxypeptidase  29.11 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2360  L,D-carboxypeptidase A  30.74 
 
 
304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.970638  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0584  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.03 
 
 
348 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0046  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  31.21 
 
 
322 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6400  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.9 
 
 
297 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.80456 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0048  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  28.08 
 
 
314 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.616431  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5967  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.31 
 
 
301 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0792878  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0209  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.07 
 
 
303 aa  122  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19840  uncharacterized MccF-like protein (microcin C7 resistance)  31.54 
 
 
306 aa  122  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.261069  decreased coverage  0.0000458463 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1333  L,D-carboxypeptidase A  30.92 
 
 
304 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000186557  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1304  L,D-carboxypeptidase A  32.66 
 
 
308 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.504378  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1938  L,D-carboxypeptidase A  30.92 
 
 
304 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1593  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  33.33 
 
 
328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1845  L,D-carboxypeptidase A  31.61 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1518  L,D-carboxypeptidase A  30.92 
 
 
304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131299  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7443  putative muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  29.34 
 
 
310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2281  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  33.66 
 
 
328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0516375  normal  0.142615 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1976  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.94 
 
 
339 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0175337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>