136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1369 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1369  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  100 
 
 
440 aa  910    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.572499  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1838  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.61 
 
 
490 aa  153  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3429  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.12 
 
 
490 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3874  lysine decarboxylase  29.69 
 
 
493 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0422494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4172  lysine decarboxylase  29.69 
 
 
493 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000808464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3977  arginine decarboxylase  29.69 
 
 
490 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3707  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  29.43 
 
 
493 aa  150  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00346407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4081  arginine decarboxylase  29.43 
 
 
490 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000678146  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4065  arginine decarboxylase  29.43 
 
 
490 aa  150  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2338  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.64 
 
 
491 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2389  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.64 
 
 
491 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1175  arginine decarboxylase  29.32 
 
 
536 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4009  lysine decarboxylase  29.17 
 
 
493 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00245624  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1437  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  28.57 
 
 
495 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2050  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.61 
 
 
493 aa  147  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0371444  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3722  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  29.17 
 
 
493 aa  147  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.159771  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3055  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.95 
 
 
485 aa  146  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3788  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.17 
 
 
509 aa  146  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0991436  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0058  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  29.74 
 
 
482 aa  146  9e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3801  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.44 
 
 
488 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0052  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  27.79 
 
 
473 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.853869  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3976  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.17 
 
 
487 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000244746  unclonable  0.000000000155031 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0963  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.46 
 
 
490 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000204147  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0035  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  29.34 
 
 
495 aa  144  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.730375  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2664  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.79 
 
 
490 aa  141  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000612019  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2805  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.76 
 
 
494 aa  141  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100172  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0031  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.21 
 
 
483 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.901763 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0425  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.39 
 
 
488 aa  140  7e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2265  arginine decarboxylase  29.19 
 
 
499 aa  139  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2157  arginine decarboxylase  29.77 
 
 
488 aa  137  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1815  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  29.04 
 
 
491 aa  136  8e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.747832  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1357  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  28.54 
 
 
508 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5242  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.7 
 
 
486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4595  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.46 
 
 
501 aa  134  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.922416  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2121  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.49 
 
 
474 aa  132  9e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.06026  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1039  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.53 
 
 
484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0028  lysine decarboxylase  28.65 
 
 
473 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0026  lysine decarboxylase  28.65 
 
 
473 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0041  arginine decarboxylase  28.83 
 
 
469 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185697 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3916  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.18 
 
 
479 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0528  Orn/Lys/Arg decarboxylase  26.79 
 
 
484 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0514  Orn/Lys/Arg decarboxylase  26.79 
 
 
484 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  28.65 
 
 
473 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0025  lysine decarboxylase  28.65 
 
 
473 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2795  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.75 
 
 
485 aa  129  7.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0160  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.15 
 
 
486 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0060  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.99 
 
 
472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.845817  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0025  lysine decarboxylase  27.86 
 
 
473 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.72 
 
 
473 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0038  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  28.12 
 
 
473 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0181  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.79 
 
 
483 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000293135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0027  lysine decarboxylase  28.12 
 
 
473 aa  127  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11741  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  26.09 
 
 
465 aa  127  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0099  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.85 
 
 
509 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000131597 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0039  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  25.88 
 
 
500 aa  126  9e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2916  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  24.83 
 
 
484 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25385  normal  0.0806797 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1918  arginine decarboxylase  28.16 
 
 
486 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000463631  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0025  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.46 
 
 
478 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.41 
 
 
472 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2291  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.06 
 
 
498 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0155  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.06 
 
 
485 aa  121  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0707  arginine decarboxylase  25.17 
 
 
489 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  27.01 
 
 
473 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5282  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  25.98 
 
 
473 aa  118  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0023  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.34 
 
 
477 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1621  arginine decarboxylase  27.3 
 
 
468 aa  114  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.460464 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2763  Orn/Lys/Arg decarboxylase  25 
 
 
476 aa  114  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.900019  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1037  hypothetical protein  25.89 
 
 
483 aa  113  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2448  Orn/Lys/Arg decarboxylase  25 
 
 
476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0220  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  25.23 
 
 
484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11911  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  26.99 
 
 
465 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0230  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  25 
 
 
484 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0240  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  25 
 
 
484 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.688738 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0502  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  25.57 
 
 
445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0515  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  25.57 
 
 
445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0947631  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3362  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  24.61 
 
 
473 aa  109  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44775  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11901  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  26.74 
 
 
465 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1006  Arginine decarboxylase  26.18 
 
 
445 aa  109  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1095  arginine decarboxylase  26.99 
 
 
463 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11021  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  27.36 
 
 
465 aa  106  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.260253 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2108  arginine decarboxylase  25.06 
 
 
485 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.970229  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09861  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  24.57 
 
 
466 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1380  arginine decarboxylase  24.44 
 
 
471 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.104521  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1276  arginine decarboxylase  28.08 
 
 
542 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.099521 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0117  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  25.69 
 
 
487 aa  103  8e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0119  Orn/Lys/Arg decarboxylase  26.58 
 
 
445 aa  102  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0120  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  25 
 
 
466 aa  99.8  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14971  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  24.36 
 
 
464 aa  93.6  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0665  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  24.36 
 
 
464 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.845174  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1040  arginine decarboxylase  24.26 
 
 
524 aa  90.1  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0511  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  23.02 
 
 
464 aa  80.9  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4300  Orn/Lys/Arg decarboxylase domain protein  32.71 
 
 
242 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1723  UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose--oxoglutarate aminotransferase  29.79 
 
 
384 aa  56.6  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.434923  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2612  UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose--oxoglutarate aminotransferase  29.79 
 
 
384 aa  56.6  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1831  UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose--oxoglutarate aminotransferase  29.79 
 
 
384 aa  56.6  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.826715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6495  TDP-4-oxo-6-deoxy-D-glucose transaminase  38.96 
 
 
409 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4015  UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose--oxoglutarate aminotransferase  29.32 
 
 
379 aa  53.5  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371945  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2079  UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose--oxoglutarate aminotransferase  29.32 
 
 
379 aa  53.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2841  UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose--oxoglutarate aminotransferase  29.01 
 
 
382 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4224  UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose--oxoglutarate aminotransferase  28.57 
 
 
380 aa  51.2  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.241717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>