More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1126 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
292 aa  581  1.0000000000000001e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19595  decreased coverage  0.000508122 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4060  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  73.1 
 
 
292 aa  393  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1124  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.82 
 
 
292 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.82 
 
 
292 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.771359  normal  0.585701 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.48 
 
 
295 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2263  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  72.16 
 
 
296 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2052  oligopeptides ABC transporter permease protein  68.5 
 
 
290 aa  356  2.9999999999999997e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04201  putative ABC transporter of oligopeptides  56.88 
 
 
283 aa  285  7e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1755  putative ABC transporter, oligopeptides  54.98 
 
 
283 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.581834  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1579  putative ABC transporter, oligopeptides  60 
 
 
273 aa  266  2.9999999999999995e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20721  putative ABC transporter, oligopeptides  56.62 
 
 
289 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.591498 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0800  putative ABC transporter, oligopeptides  57.25 
 
 
290 aa  261  6.999999999999999e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.494222  normal  0.0258262 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04771  putative ABC transporter, oligopeptides  57.14 
 
 
252 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0213  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter permease  41.94 
 
 
389 aa  247  1e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.47 
 
 
287 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.77 
 
 
341 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00013185 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.44 
 
 
287 aa  242  5e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.53 
 
 
341 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108082  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.52 
 
 
290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.287104  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.51 
 
 
291 aa  226  4e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0926789  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0417  putative ABC transporter, oligopeptides  51.15 
 
 
273 aa  226  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04721  putative ABC transporter, oligopeptides  56.03 
 
 
251 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.0069399  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04411  putative ABC transporter, oligopeptides  55.6 
 
 
251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.53 
 
 
374 aa  219  6e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0144  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  41.89 
 
 
317 aa  212  5.999999999999999e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04821  putative ABC transporter, oligopeptides  55.45 
 
 
248 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.23 
 
 
262 aa  202  4e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.08 
 
 
286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0603  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 
262 aa  200  3e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.452805  hitchhiker  0.000000299864 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18020  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  42.31 
 
 
343 aa  199  5e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.318442  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1495  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.46 
 
 
263 aa  190  2e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.55 
 
 
296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
309 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 
310 aa  177  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
310 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  36.3 
 
 
299 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  36.3 
 
 
299 aa  176  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  36.9 
 
 
299 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  36.3 
 
 
299 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  36.3 
 
 
299 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
299 aa  175  8e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.553979  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
299 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111328  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
298 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0407535  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
469 aa  172  5e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.96 
 
 
305 aa  172  6.999999999999999e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.95778  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.97 
 
 
299 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.95 
 
 
299 aa  171  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
295 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  35.19 
 
 
867 aa  169  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5351  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  37.5 
 
 
317 aa  169  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.86 
 
 
313 aa  169  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.26 
 
 
299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.109416  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1395  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  36.53 
 
 
288 aa  166  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.064701  decreased coverage  0.00784209 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.54 
 
 
294 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.789298  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
294 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881682  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0890  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  33.33 
 
 
303 aa  165  9e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.221253  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1636  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.24 
 
 
293 aa  165  9e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.19302  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2716  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00799  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  33.7 
 
 
303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.482593  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265268  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2172  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  33.59 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1570  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  33.59 
 
 
298 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00816  hypothetical protein  33.7 
 
 
303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01443  D-ala-D-ala transporter subunit  33.59 
 
 
298 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.45304  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2516  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  33.33 
 
 
303 aa  163  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245881  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.01 
 
 
287 aa  163  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2097  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  33.59 
 
 
298 aa  163  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0857  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  33.33 
 
 
303 aa  163  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01455  hypothetical protein  33.59 
 
 
298 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.47297  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0903  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  33.33 
 
 
303 aa  163  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0983  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  33.33 
 
 
303 aa  163  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.631876 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
304 aa  163  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1674  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  33.59 
 
 
298 aa  163  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1688  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  33.59 
 
 
298 aa  163  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.175944  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5359  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  36.4 
 
 
289 aa  162  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.632265  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0952  glutathione transport system permease GsiD  34.72 
 
 
303 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0892  glutathione transport system permease protein GsiD  34.72 
 
 
303 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0981  glutathione transport system permease GsiD  34.72 
 
 
303 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0919  glutathione transport system permease protein GsiD  34.72 
 
 
303 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.285756  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1002  glutathione transport system permease GsiD  34.72 
 
 
303 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
298 aa  161  9e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00686598  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
300 aa  162  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.765267  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4119  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  32.03 
 
 
282 aa  162  9e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2756  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.78 
 
 
303 aa  161  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.86 
 
 
359 aa  161  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1924  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.45 
 
 
303 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
312 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0838  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  34.71 
 
 
301 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00766751  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2848  ABC transporter permease protein  36.47 
 
 
276 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.72 
 
 
299 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213083  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 
299 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.356305  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.17 
 
 
303 aa  159  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.28 
 
 
310 aa  158  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
298 aa  158  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00781305  normal  0.217965 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>