49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0936 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0936  CRISPR-associated protein Cas4  100 
 
 		 169 aa  348  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1391  hypothetical protein  71.93 
 
 		 171 aa  239  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.268781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1000  hypothetical protein  68.75 
 
 		 172 aa  236  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1083  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.66 
 
 		 172 aa  98.6  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2015  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.94 
 
 		 170 aa  95.1  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0918  CRISPR-associated protein Cas4  26.42 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000176613 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0302  hypothetical protein  31.48 
 
 		 199 aa  86.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00784243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1728  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.54 
 
 		 177 aa  84.7  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3932  CRISPR-associated protein Cas4  31.1 
 
 		 169 aa  84.3  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0309  CRISPR-associated protein Cas4  31.71 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0126  CRISPR-associated protein Cas4  28.3 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2517  hypothetical protein  29.63 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2837  CRISPR-associated protein Cas4  29.76 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.679978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2660  CRISPR-associated protein Cas4  29.63 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0941  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.93 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1187  CRISPR-associated protein Cas4  32.32 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2023  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.63 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.84369  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0447  CRISPR-associated protein Cas4  29.81 
 
 		 166 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0672  CRISPR-associated protein Cas4  29.01 
 
 		 169 aa  77.4  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2004  CRISPR-associated protein Cas4  32.1 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0540  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.78 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2298  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.22 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1638  CRISPR-associated protein Cas4  32.95 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270939  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2429  CRISPR-associated protein Cas4  32.32 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4287  CRISPR-associated protein Cas4  26.99 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0976  CRISPR-associated protein Cas4  30.34 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0914  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.74 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0131013  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1229  CRISPR-associated protein Cas4  25.31 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1126  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.51 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00956788  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1878  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.51 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3001  CRISPR-associated protein Cas4  29.01 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0454064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1812  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.54 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233304  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3328  CRISPR-associated protein Cas4  27.67 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1423  CRISPR-associated protein Cas4  26.01 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.283584  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2318  CRISPR-associated Cas4 family protein  22.52 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1289  CRISPR-associated protein Cas4  26.06 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0902  CRISPR-associated protein Cas4  26.54 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.057649  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1450  CRISPR-associated protein Cas4  28.75 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0664  CRISPR-associated protein Cas4  27.27 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0807388  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0349  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.77 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.177576  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0266  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  28.65 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0620  CRISPR-associated protein Cas4  23.81 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2270  CRISPR-associated protein Cas4  22.03 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1020  CRISPR-associated protein Cas4  27.5 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000334057  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  32.26 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1804  RecB family exonuclease  28.57 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  34.09 
 
 		 216 aa  44.3  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.74 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.55 
 
 		 544 aa  40.8  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>