49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0918 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0918  CRISPR-associated protein Cas4  100 
 
 
162 aa  328  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000176613 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1229  CRISPR-associated protein Cas4  46.58 
 
 
167 aa  149  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1126  CRISPR-associated Cas4 family protein  45.68 
 
 
199 aa  144  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00956788  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1728  CRISPR-associated Cas4 family protein  40.61 
 
 
177 aa  135  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1083  CRISPR-associated Cas4 family protein  40.48 
 
 
172 aa  133  9e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0126  CRISPR-associated protein Cas4  41.36 
 
 
171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0447  CRISPR-associated protein Cas4  43.75 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2023  CRISPR-associated Cas4 family protein  43.12 
 
 
165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.84369  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0302  hypothetical protein  39.88 
 
 
199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00784243  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0672  CRISPR-associated protein Cas4  39.26 
 
 
169 aa  115  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2004  CRISPR-associated protein Cas4  40.37 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0914  CRISPR-associated Cas4 family protein  39.63 
 
 
173 aa  111  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0131013  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2837  CRISPR-associated protein Cas4  31.68 
 
 
186 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.679978  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2015  CRISPR-associated Cas4 family protein  42.33 
 
 
170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1638  CRISPR-associated protein Cas4  32.39 
 
 
180 aa  105  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270939  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2298  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.81 
 
 
170 aa  100  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2660  CRISPR-associated protein Cas4  34.76 
 
 
185 aa  100  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0540  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.16 
 
 
168 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0664  CRISPR-associated protein Cas4  37.13 
 
 
161 aa  98.6  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0807388  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1450  CRISPR-associated protein Cas4  34.78 
 
 
192 aa  97.8  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0941  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.58 
 
 
163 aa  97.1  8e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4287  CRISPR-associated protein Cas4  31.71 
 
 
169 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0902  CRISPR-associated protein Cas4  36.97 
 
 
163 aa  95.9  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.057649  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3932  CRISPR-associated protein Cas4  31.9 
 
 
169 aa  95.5  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1812  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.86 
 
 
178 aa  95.5  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233304  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0309  CRISPR-associated protein Cas4  35.37 
 
 
165 aa  91.7  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1020  CRISPR-associated protein Cas4  33.73 
 
 
161 aa  90.9  6e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000334057  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3001  CRISPR-associated protein Cas4  36.75 
 
 
162 aa  90.1  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0454064  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3328  CRISPR-associated protein Cas4  29.88 
 
 
189 aa  88.6  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2318  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.54 
 
 
165 aa  86.7  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0936  CRISPR-associated protein Cas4  26.42 
 
 
169 aa  86.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2429  CRISPR-associated protein Cas4  32.1 
 
 
165 aa  85.9  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1187  CRISPR-associated protein Cas4  33.54 
 
 
169 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2517  hypothetical protein  29.88 
 
 
168 aa  84  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0976  CRISPR-associated protein Cas4  29.01 
 
 
177 aa  82  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1000  hypothetical protein  25.62 
 
 
172 aa  81.3  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1391  hypothetical protein  25.79 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.268781  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0266  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  29.01 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0349  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.54 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.177576  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1423  CRISPR-associated protein Cas4  30 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.283584  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0620  CRISPR-associated protein Cas4  34.36 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1878  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.48 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1804  RecB family exonuclease  33.33 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0395  CRISPR-associated protein Cas4  37.88 
 
 
127 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0424779  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1289  CRISPR-associated protein Cas4  28.83 
 
 
165 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1022  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.05 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  32.81 
 
 
204 aa  47.4  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2723  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.16 
 
 
208 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  28.12 
 
 
218 aa  40.4  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>