46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1229 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1229  CRISPR-associated protein Cas4  100 
 
 
167 aa  337  5e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0918  CRISPR-associated protein Cas4  46.58 
 
 
162 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000176613 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0672  CRISPR-associated protein Cas4  35.85 
 
 
169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0447  CRISPR-associated protein Cas4  41.25 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1083  CRISPR-associated Cas4 family protein  38.41 
 
 
172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0914  CRISPR-associated Cas4 family protein  41.25 
 
 
173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0131013  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1638  CRISPR-associated protein Cas4  33.91 
 
 
180 aa  108  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270939  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0126  CRISPR-associated protein Cas4  36.31 
 
 
171 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1126  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.65 
 
 
199 aa  103  8e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00956788  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1728  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.73 
 
 
177 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_002950  PG2015  CRISPR-associated Cas4 family protein  40 
 
 
170 aa  101  5e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0540  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.16 
 
 
168 aa  97.1  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0976  CRISPR-associated protein Cas4  33.33 
 
 
177 aa  94.4  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0302  hypothetical protein  37.65 
 
 
199 aa  91.7  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00784243  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3932  CRISPR-associated protein Cas4  33.33 
 
 
169 aa  91.3  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0309  CRISPR-associated protein Cas4  35.8 
 
 
165 aa  91.7  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3328  CRISPR-associated protein Cas4  27.88 
 
 
189 aa  90.5  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2318  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.92 
 
 
165 aa  89.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2298  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.97 
 
 
170 aa  88.6  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4287  CRISPR-associated protein Cas4  31.29 
 
 
169 aa  87.8  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2023  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.59 
 
 
165 aa  87.4  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.84369  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3001  CRISPR-associated protein Cas4  33.74 
 
 
162 aa  87.4  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0454064  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2429  CRISPR-associated protein Cas4  31.48 
 
 
165 aa  87  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2517  hypothetical protein  36.05 
 
 
168 aa  85.9  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1187  CRISPR-associated protein Cas4  37.8 
 
 
169 aa  85.9  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2004  CRISPR-associated protein Cas4  33.33 
 
 
165 aa  85.9  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0266  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  28.4 
 
 
162 aa  84  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2837  CRISPR-associated protein Cas4  23.42 
 
 
186 aa  83.6  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.679978  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0902  CRISPR-associated protein Cas4  34.97 
 
 
163 aa  83.6  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.057649  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0941  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.92 
 
 
163 aa  83.6  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2660  CRISPR-associated protein Cas4  32.52 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1450  CRISPR-associated protein Cas4  29.56 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1020  CRISPR-associated protein Cas4  29.81 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000334057  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1812  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.1 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233304  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0936  CRISPR-associated protein Cas4  25.31 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1878  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.31 
 
 
170 aa  70.9  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0664  CRISPR-associated protein Cas4  32.34 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0807388  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0349  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.44 
 
 
158 aa  67  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.177576  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1804  RecB family exonuclease  32.54 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0620  CRISPR-associated protein Cas4  32.93 
 
 
168 aa  63.5  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1391  hypothetical protein  23.03 
 
 
171 aa  62.4  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.268781  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1000  hypothetical protein  24.22 
 
 
172 aa  62  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1423  CRISPR-associated protein Cas4  28.48 
 
 
166 aa  50.8  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.283584  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1289  CRISPR-associated protein Cas4  29.09 
 
 
165 aa  50.4  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0395  CRISPR-associated protein Cas4  32.61 
 
 
127 aa  49.7  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0424779  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1022  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.38 
 
 
159 aa  48.5  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>