48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0620 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0620  CRISPR-associated protein Cas4  100 
 
 
168 aa  339  9e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2318  CRISPR-associated Cas4 family protein  56.79 
 
 
165 aa  197  6e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0976  CRISPR-associated protein Cas4  46.3 
 
 
177 aa  169  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1812  CRISPR-associated Cas4 family protein  43.83 
 
 
178 aa  164  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233304  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0309  CRISPR-associated protein Cas4  45.68 
 
 
165 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1187  CRISPR-associated protein Cas4  47.53 
 
 
169 aa  157  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3932  CRISPR-associated protein Cas4  46.01 
 
 
169 aa  150  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2298  CRISPR-associated Cas4 family protein  45.68 
 
 
170 aa  149  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0941  CRISPR-associated Cas4 family protein  44.44 
 
 
163 aa  148  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0540  CRISPR-associated Cas4 family protein  42.86 
 
 
168 aa  147  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2429  CRISPR-associated protein Cas4  42.59 
 
 
165 aa  147  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2517  hypothetical protein  46.3 
 
 
168 aa  145  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1878  CRISPR-associated Cas4 family protein  43.29 
 
 
170 aa  142  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2660  CRISPR-associated protein Cas4  43.21 
 
 
185 aa  142  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4287  CRISPR-associated protein Cas4  43.56 
 
 
169 aa  141  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0349  CRISPR-associated Cas4 family protein  40.49 
 
 
158 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.177576  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0266  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  38.65 
 
 
162 aa  134  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2837  CRISPR-associated protein Cas4  33.53 
 
 
186 aa  117  9e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.679978  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1020  CRISPR-associated protein Cas4  39.51 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000334057  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0302  hypothetical protein  36.65 
 
 
199 aa  105  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00784243  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1022  CRISPR-associated Cas4 family protein  39.88 
 
 
159 aa  104  6e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3328  CRISPR-associated protein Cas4  31.33 
 
 
189 aa  103  8e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1126  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.19 
 
 
199 aa  100  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00956788  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0126  CRISPR-associated protein Cas4  36.02 
 
 
171 aa  98.2  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2023  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.59 
 
 
165 aa  95.5  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.84369  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2004  CRISPR-associated protein Cas4  33.74 
 
 
165 aa  94.4  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1083  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.09 
 
 
172 aa  93.6  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1638  CRISPR-associated protein Cas4  31.07 
 
 
180 aa  92.8  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270939  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0914  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.76 
 
 
173 aa  91.7  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0131013  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1450  CRISPR-associated protein Cas4  31.9 
 
 
192 aa  90.5  9e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1289  CRISPR-associated protein Cas4  36.2 
 
 
165 aa  89.7  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0672  CRISPR-associated protein Cas4  33.54 
 
 
169 aa  88.6  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0664  CRISPR-associated protein Cas4  34.94 
 
 
161 aa  87.4  8e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0807388  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0918  CRISPR-associated protein Cas4  34.36 
 
 
162 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000176613 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1423  CRISPR-associated protein Cas4  32.93 
 
 
166 aa  85.9  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.283584  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0447  CRISPR-associated protein Cas4  33.33 
 
 
166 aa  84.7  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0902  CRISPR-associated protein Cas4  31.52 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.057649  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1229  CRISPR-associated protein Cas4  32.93 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3001  CRISPR-associated protein Cas4  31.33 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0454064  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1728  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.83 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_002950  PG2015  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.93 
 
 
170 aa  63.9  0.0000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0936  CRISPR-associated protein Cas4  23.95 
 
 
169 aa  61.2  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1804  RecB family exonuclease  32.93 
 
 
162 aa  61.2  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1000  hypothetical protein  22.84 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0395  CRISPR-associated protein Cas4  29.1 
 
 
127 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0424779  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  27.66 
 
 
550 aa  48.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.19 
 
 
198 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1150  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.37 
 
 
171 aa  42.4  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.686649  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>