48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3932 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3932  CRISPR-associated protein Cas4  100 
 
 
169 aa  350  4e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0540  CRISPR-associated Cas4 family protein  56.21 
 
 
168 aa  204  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0309  CRISPR-associated protein Cas4  59.26 
 
 
165 aa  197  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4287  CRISPR-associated protein Cas4  52.07 
 
 
169 aa  192  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1187  CRISPR-associated protein Cas4  58.79 
 
 
169 aa  184  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2517  hypothetical protein  53.25 
 
 
168 aa  179  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2318  CRISPR-associated Cas4 family protein  50.91 
 
 
165 aa  174  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2660  CRISPR-associated protein Cas4  50.62 
 
 
185 aa  167  5e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0976  CRISPR-associated protein Cas4  47.85 
 
 
177 aa  166  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2298  CRISPR-associated Cas4 family protein  49.7 
 
 
170 aa  164  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1812  CRISPR-associated Cas4 family protein  45.68 
 
 
178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233304  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0941  CRISPR-associated Cas4 family protein  47.85 
 
 
163 aa  160  9e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2429  CRISPR-associated protein Cas4  46.01 
 
 
165 aa  157  8e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0266  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  43.21 
 
 
162 aa  149  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0620  CRISPR-associated protein Cas4  46.01 
 
 
168 aa  139  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1878  CRISPR-associated Cas4 family protein  39.51 
 
 
170 aa  138  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0672  CRISPR-associated protein Cas4  39.16 
 
 
169 aa  124  8.000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2023  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.58 
 
 
165 aa  117  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.84369  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0126  CRISPR-associated protein Cas4  35.5 
 
 
171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0914  CRISPR-associated Cas4 family protein  38.41 
 
 
173 aa  114  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0131013  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2004  CRISPR-associated protein Cas4  38.65 
 
 
165 aa  112  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0349  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.65 
 
 
158 aa  111  5e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.177576  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2837  CRISPR-associated protein Cas4  36.75 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.679978  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0302  hypothetical protein  36.65 
 
 
199 aa  106  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00784243  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1126  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.74 
 
 
199 aa  103  8e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00956788  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3328  CRISPR-associated protein Cas4  36.53 
 
 
189 aa  102  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1020  CRISPR-associated protein Cas4  36.42 
 
 
161 aa  100  8e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000334057  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1728  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.14 
 
 
177 aa  99.8  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1022  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.65 
 
 
159 aa  98.2  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0918  CRISPR-associated protein Cas4  31.9 
 
 
162 aa  95.5  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000176613 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0902  CRISPR-associated protein Cas4  32.93 
 
 
163 aa  94.7  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.057649  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1423  CRISPR-associated protein Cas4  34.52 
 
 
166 aa  94  8e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.283584  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1229  CRISPR-associated protein Cas4  33.33 
 
 
167 aa  91.3  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1450  CRISPR-associated protein Cas4  35.54 
 
 
192 aa  90.1  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0664  CRISPR-associated protein Cas4  33.73 
 
 
161 aa  87.8  6e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0807388  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1638  CRISPR-associated protein Cas4  32.43 
 
 
180 aa  87  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270939  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0447  CRISPR-associated protein Cas4  36.84 
 
 
166 aa  85.5  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1083  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.75 
 
 
172 aa  84.7  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3001  CRISPR-associated protein Cas4  32.12 
 
 
162 aa  84.3  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0454064  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0936  CRISPR-associated protein Cas4  31.1 
 
 
169 aa  84.3  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1289  CRISPR-associated protein Cas4  33.73 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2015  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.13 
 
 
170 aa  77.4  0.00000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1391  hypothetical protein  26.79 
 
 
171 aa  77  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.268781  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1000  hypothetical protein  25.15 
 
 
172 aa  70.5  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1804  RecB family exonuclease  35.24 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0395  CRISPR-associated protein Cas4  30.6 
 
 
127 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0424779  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.97 
 
 
198 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  28.75 
 
 
202 aa  42.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>